Capnofile er mikroorganismer, der trives i nærvær af høje koncentrationer af kuldioxid (CO
2).
Nogle capnofile kan have et metabolisk behov for kuldioxid, mens andre blot konkurrerer mere effektivt om ressourcerne under disse forhold. Udtrykket er generelt beskrivende og har mindre relevans som et middel til at etablere et taksonomisk eller evolutionært forhold mellem organismer med denne egenskab.
Til eksempel kan capnofiles evne til at tolerere (eller udnytte) den mængde ilt, der også er i deres omgivelser, variere meget og kan være langt mere kritisk for deres overlevelse. Arter af Campylobacter er bakterielle capnofile bakterier, der er lettere at identificere, fordi de også er mikroaerofile, dvs. organismer, der kan vokse i høj kuldioxid, så længe der er en lille mængde fri ilt til stede, men i en dramatisk reduceret koncentration. (I jordens atmosfære er kuldioxidniveauet ca. fem hundrede gange lavere end iltniveauet, henholdsvis 0,04 % og 21 % af det samlede indhold). Obligate anaerober er mikrober, der vil dø i tilstedeværelse af ilt uden hensyn til koncentrationen af kuldioxid i deres omgivelser, og som typisk får energi gennem anaerob respiration eller fermentering.
I 2004 blev en kapnofil bakterie karakteriseret, som tilsyneladende kræver kuldioxid. Denne organisme, Mannheimia succiniciproducens, har en unik metabolisme, der involverer kulstoffiksering. Mens kulstoffiksering er fælles for det meste planteliv på jorden, da det er det vigtigste indledende trin i biosyntesen af komplekse kulstofforbindelser under fotosyntesen (Calvin-cyklusen), findes det i relativt få mikroorganismer og ikke hos dyr. M. succiniciproducens kan binde kuldioxid til den tre kulstofholdige rygsøjle af phosphoenolpyruvat, et slutprodukt i glykolysen, for at generere den fire kulstofholdige forbindelse, oxaloeddikesyre, et mellemprodukt i Krebs-cyklusen. Selv om M. succiniciproducens har de fleste af mellemprodukterne i Krebs-cyklusen, synes den ikke at være i stand til aerob respiration, idet den i stedet bruger fumarat som en endelig elektronacceptor.