Capsomeren er en underenhed af capsidet, et ydre proteinhylster, der beskytter det genetiske materiale i en virus. Capsomerer samler sig selv for at danne capsidet.
I dette diagram af et Adenovirus ses capsidmolekylerne tydeligt.
Underenheder kaldet protomerer samler sig for at danne capsomerer. Der findes forskellige arrangementer af capsomerer: 1) Icosahedral, 2) Helical og 3) Complex.
1) Icosahedral- En icosahedron er et polyeder med 12 hjørner og 20 flader. To typer capsomerer udgør det icosaedriske capsid: pentagonale (pentoner) ved hjørnerne og hexagonale (hexoner) ved fladerne. Der er altid tolv pentoner, men antallet af hexoner varierer mellem virusgrupper. På elektronmikrografer kan capsomerer genkendes som regelmæssigt adskilte ringe med et centralt hul.
2) Helikale- Protomererne er ikke grupperet i capsomerer, men er bundet til hinanden, således at de danner en båndlignende struktur. Denne struktur folder sig til en helix, fordi protomererne er tykkere i den ene ende end i den anden ende. Diameteren af det helikale capsid bestemmes af egenskaberne ved dets protomerer, mens dets længde bestemmes af længden af den nukleinsyre, det omslutter.
3) Kompleks- f.eks. det, der udvises af poxvirus og rhabdovirus. Denne gruppe omfatter alle de virus, der ikke passer ind i nogen af de to ovennævnte grupper.
Når viruspartiklen er kommet ind i en værtscelle, fordøjer værtscellens enzymer capsidet og de capsomerer, der udgør det, hvorved det nøgne genetiske materiale (DNA/RNA) i viruset blotlægges, som efterfølgende går ind i replikationscyklusen.
Capsomererne beskytter mod fysiske, kemiske og enzymatiske skader og er mangfoldigt redundante; de har nogle få proteinunderenheder, der gentages. Dette skyldes, at viralgenomet er så økonomisk som muligt ved kun at have brug for få proteinkodoner til at lave en stor struktur. En af de vigtigste funktioner for et capsid er at indføre det indesluttede virale genom i værtsceller ved at adsorbere let på værtscellens overflade.