CAZy

Denne artikel handler om databasen. For lokalsamfundet i USA, se Cazy, West Virginia.

CAZy er en database over kulhydrat-aktive enZymer (CAZymes). Databasen indeholder en klassifikation og tilhørende oplysninger om enzymer, der er involveret i syntese, metabolisme og genkendelse af komplekse kulhydrater, dvs. disaccharider, oligosaccharider, polysaccharider og glykokonjugater. Databasen omfatter familier af glykosidhydrolaser, glykosyltransferaser, polysaccharidlyaser, kulhydratesteraser og ikke-katalytiske kulhydratbindende moduler. CAZy-databasen omfatter også en klassifikation af redoxenzymer med hjælpeaktivitet, der er involveret i nedbrydningen af lignocellulose.

CAZy

Database.png

Indhold

Beskrivelse

Karbohydrataktive enzymer database

Kontakt

Forskningscenter

AFMB, Fransk nationalt center for videnskabelig forskning

Laboratorium

Glykogenomisk gruppe

Primært citat

Lombard & al. (2014)

Access

Website

http://www.cazy.org/

Tools

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy blev oprettet i 1999 med henblik på at give online og konstant opdateret adgang til den proteinsekvensbaserede familieklassifikation af CAZymer, som oprindeligt blev udviklet i begyndelsen af 1990’erne for at klassificere glykosidhydrolaserne. Nye poster tilføjes kort tid efter, at de optræder i de daglige udgivelser af GenBank. Den hurtige udvikling inden for DNA-sekventering med høj kapacitet har resulteret i en fortsat eksponentiel vækst i CAZy-databasen, som nu omfatter hundredtusindvis af sekvenser. CAZy bliver fortsat kurateret og udviklet af Glycogenomics-gruppen ved AFMB, et forskningscenter tilknyttet det franske nationale center for videnskabelig forskning og Aix-Marseille Universitet.

Databasen CAZy er koblet sammen med CAZypedia, som blev lanceret i 2007 som et forskningsfællesskabsdrevet, wikibaseret leksikon om CAZymer.

Skriv en kommentar