Centimorgan (forkortet cM, opkaldt efter Thomas Hunt Morgan) er en hjælpemåleenhed i genetik, der angiver frekvensen eller sandsynligheden for rekombination i procent. På denne måde kan den genetiske afstand kvantificeres, dvs. den genetiske afstand mellem to loci på et kromosom.
Gener, der befinder sig på det samme kromosom, kan “afkobles” ved at krydse over. Det forventede antal af disse cross-over hændelser kan estimeres ud fra den (observerede) rekombinationsfrekvens.
To loci er 1 cM fra hinanden, hvis rekombinationen (dvs. sandsynligheden for krydsning mellem disse loci er 1 % pr. meiose, dvs. at der i gennemsnit sker én krydsning pr. 100 meioser:
R e k o m b i n a t i o n = 100 ⋅ D e r e k o m b i n a t i o n {\displaystyle \mathrm {rekombination\,} =100\cdot {\frac {\mathrm {\mathrm {antal\;af\;rekombinant\;gameter} }{\mathrm {gametes;total} }} 
(for at danne en zygote har man brug for to gameter, og ved dannelsen af hver af dem kan der være sket rekombination).