Dallas CowboysRediger
Canty blev valgt i fjerde runde (132. samlede valg) i NFL-draften i 2005 af Dallas Cowboys. Efter at være gået ind i sin seniorsæson som et potentielt første runde-draftvalg faldt han på grund af den knæskade, han pådrog sig som senior, samt en nethindeløsning i venstre øje, der blev påført ham i foråret forud for draftet. Cowboys byttede deres femte runde valg i 2005 og en fjerde runde valg i 2006 til Philadelphia Eagles for at rykke op. Canty underskrev en treårig kontrakt på 1,3 millioner dollars med Cowboys.
Efter at have arbejdet hele foråret og sommeren på at genoptræne sit knæ og komme sig efter den skadede nethinde, var Canty på banen en uge inde i træningslejren. Som rookie registrerede han 35 tacklinger (24 solo), var nummer to på holdet med fem tacklinger for tab og lå på fjerdepladsen i klubben med 2,5 sacks.
Canty spillede i sæsonåbneren hos San Diego Chargers og registrerede sin første NFL-tackling sammen med et quarterbackpres. Mod Washington Redskins tilføjede han sit første sack i karrieren med en tackling af Mark Brunell i tredje kvarter. Han var nummer tre på holdet og nummer et blandt linemen med sæsonhøjde seks tacklinger mod Oakland Raiders. Han tilføjede også en halv sack og en tackling for et tab. Canty havde to tacklinger mod Philadelphia Eagles, da forsvaret begrænsede Eagles til 129 samlede yards, herunder kun 19 på jorden, hvilket er det fjerde laveste antal rushing yards i franchisens historie. Canty havde sæsonhøjde med to quarterback pressures mod Arizona Cardinals samt en tackling og en tackling for et tab. Mod Philadelphia spillede han mest på første og anden downs, noterede to tacklinger, en tackling for et tab og en tvunget fumble. Canty førte alle linjemænd med tre tacklinger og tilføjede sin anden sack i sæsonen mod Denver Broncos. Hos New York Giants fik han sin første NFL-start, da han erstattede (Greg) Ellis på højre kant og noterede sig for fire tacklinger. Han startede igen ugen efter mod Kansas City Chiefs og førte alle forsvarsspillere med fem tacklinger, selv om han fik en forstuvet ankel i løbet af kampen. Han startede ikke, men spillede mod Washington efter at have misset to dages træning på grund af den skadede ankel. Han noterede to tacklinger og en tackling for et tab mod Carolina Panthers. I sæsonfinalen mod St. Louis Rams førte Canty alle forsvarsspillere med fem tacklinger og havde også en tackling for et tab.
I 2006 gik holdet over til et 3-4-forsvar, og Canty fik startrollen som højre forsvarsspiller. Han startede i alle 16 kampe i den regulære sæson og Dallas’ eneste playoffkamp. Han noterede 33 tackles og 1 sack.
I 2007 registrerede han 43 tackles (30 solo), 3,5 sacks og 2 pass defensed. I Cowboys enlige playoffkamp, deres tredje kamp mod New York Giants i sæsonen, registrerede Canty tre tacklinger (to solo), et sack og en pass defensed.
Efter Cowboys tog beslutningen om at give en femårig forlængelse til Jay Ratliff, den 11. juni 2008 sæson, underskrev Canty et etårigt tilbud på 2,017 millioner dollars for at blive hos holdet. Han startede alle 16 kampe for tredje år i træk og producerede 37 tacklinger (25 solo), 3 sacks og et karrierehøjde på 5 pass defensed.
New York GiantsRediger
Den 1. marts 2009 skrev Canty under med New York Giants; den seksårige kontrakt har en værdi af 42 millioner dollars, hvoraf 17,25 millioner dollars er garanteret. Han blev udnævnt som starter på højre defensive tackle i holdets daværende 4-3-forsvar, men missede otte kampe med knæ- og hamstringskader. I 2011 registrerede han karrierens højeste antal tacklinger (47) og sacks (4).
I slutningen af 2011-sæsonen var Canty og Giants med i Super Bowl XLVI. Han startede i kampen, da Giants besejrede New England Patriots med 21-17.
Den 27. august 2012 blev Canty sat på listen over fysisk uarbejdsdygtige spillere, efter at det blev fastslået, at han havde brug for mere tid til at komme sig efter en knæoperation uden for sæsonen. Den 20. oktober blev han aktiveret fra PUP-listen. Den 2. november blev han idømt en bøde på 15.750 dollars for roughing the passer. Canty pådrog sig en forstuvet MCL den 23. december mod Baltimore Ravens og missede sæsonfinalen. Efter kun at have spillet i 9 kampe registrerede han 25 tackles (20 solo) og 3 sacks.
Han blev frigivet af Giants den 6. februar 2013 i et salary cap move.
Baltimore RavensRediger
Canty underskrev som free agent med Baltimore Ravens den 12. marts 2013. Han registrerede 30 tacklinger, 2 sacks og 2 forced fumbles, mens han spillede venstre defensive end i det daværende Ravens 3-4-forsvar. I 2014 missede han fem kampe, mens han kæmpede med ankelskader og en stafylokokinfektion i håndleddet. Han blev skåret af Ravens den 27. februar 2015. Ravens signede ham derefter igen den 18. marts 2015.