Citrat-syntase

articles

articles

proteiner

Citrat (Si)-synthase
Identifikatorer
EC nr. 2.3.3.3.1
CAS nr. 9027-96-7
Databaser
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA post
ExPASy NiceZyme visning
KEGG KEGG-post
MetaCyc metabolisk vej
PRIAM profil
PDB-strukturer RCSB PDB PDBe PDBsum
Genontologi AmiGO / QuickGO
Search PMC PubMed NCBI

MechanismEdit

Citrat-syntase har tre nøgleaminosyrer i sit aktive sted (kendt som den katalytiske triade), som katalyserer omdannelsen af acetyl-CoA og oxaloacetat til citrat og H-SCoA i en aldolkondensationsreaktion. Denne omdannelse begynder med det negativt ladede carboxylat-sidekædens oxygenatom i Asp-375, der deprotonerer acetyl-CoA’s alfa-kulstofatom for at danne en enolat-anion, som igen neutraliseres ved protonering af His-274 for at danne et enol-intermediat . På dette tidspunkt abstraherer epsilon-nitrogenets enlige elektronpar på His-274, der blev dannet i sidste trin, hydroxyl-enolprotonen for at danne en enolat-anion, der indleder et nukleofilt angreb på oxaloacetatets carbonylkulstof, som igen deprotonerer epsilon-nitrogenatomet på His-320. Denne nukleofile addition resulterer i dannelsen af citroyl-CoA . På dette tidspunkt deprotoneres et vandmolekyle af His-320’s epsilon nitrogenatom, og hydrolysen indledes. Et af iltets ensomme par angriber nukleofilt carbonylkulstoffet i citroyl-CoA. Dette danner et tetraederformet mellemprodukt og resulterer i udstødning af -SCoA, idet carbonylstoffet reformeres. -SCoA protoneres for at danne HSCoA. Endelig deprotoneres den hydroxyl, der blev tilføjet til carbonylet i det foregående trin, og der dannes citrat.

Mekanisme for citratsyntase (herunder involverede rester)

HæmningRediger

Enzymet hæmmes af høje forhold mellem ATP:ADP og NADH:NAD, da høje koncentrationer af ATP og NADH viser, at energitilførslen er høj for cellen. Det hæmmes også af succinyl-CoA og propionyl-CoA, som ligner Acetyl-coA og virker som en kompetitiv hæmmer over for acetyl-CoA og en ikke-kompetitiv hæmmer over for oxaloacetat. Citrat hæmmer reaktionen og er et eksempel på produkthæmning. hæmningen af citratsyntase med acetyl-CoA-analoger er også veldokumenteret og er blevet brugt til at bevise eksistensen af et enkelt aktivt sted. Disse eksperimenter har afsløret, at dette enkeltsted veksler mellem to former, som deltager i henholdsvis ligase- og hydrolaseaktivitet. Dette protein kan anvende morfeein-modellen for allosterisk regulering.

Skriv en kommentar