De kerneværdier, som Cooperative Baptist Fellowship fastholder, begynder med fire punkter, som CBF betragter som baptistiske principper for tro og praksis.
- Sjælsfrihed er alle menneskers evne til at have en direkte forbindelse med Gud. Troen på alle troendes præstedømme er et vigtigt grundlag for dette princip.
- Bibelfrihed er princippet om at anerkende Skriftens autoritet og enhver kristens ret til at fortolke den, som Helligånden leder den.
- Kirkefrihed er tanken om, at enhver lokal kirke er selvstændig og bemyndiget til at vælge sine egne ledere og lede sine egne anliggender.
- Religionsfrihed er princippet om adskillelse af kirke og stat. CBF støtter dette princip gennem tilslutning til Baptist Joint Committee for Religious Liberty.
CBF bekræfter, at Bibelen lærer, at der er én sand Gud, som har skabt alle mennesker. På grund af synden er menneskeheden adskilt fra Gud, men kan blive frelst og forløst gennem Jesus Kristus. Helligånden overbeviser og omvender dem, der tror på Kristus, og giver kirken magt til at opfylde sin mission. CBF-medlemmer er enige om, at enhver kristen og enhver kirke er kaldet til at opfylde missionsbefalingen, dele evangeliet om Jesus Kristus og tjene de åndelige, fysiske og sociale behov hos mennesker og samfund.
Affirmation af kvinder i præstegerningen var et af de grundlæggende principper for Fellowship. De fleste CBF-medlemmer er enige om, at både mænd og kvinder kan blive ordineret som præster eller diakoner og tjene som præster i kirker. I sociale spørgsmål afgiver CBF ingen holdningstilkendegivelser. CBF’s medlemmer er enige om, at da CBF er et fællesskab af selvstændige kirker, ville det ligge uden for dets formål at udstede udtalelser. Den har dog en organisationspolitik vedrørende homoseksuel adfærd. CBF’s politikker er imidlertid ikke bindende for de enkelte menigheder, som træffer deres egne beslutninger om ethvert spørgsmål; en menighed kan heller ikke udelukkes fra CBF, fordi den ikke er enig i de centrale værdier eller politikker. F.eks. tillader Calvary Baptist Church i Lexington, KY, en af de førende medlemsforsamlinger i CBF, at homoseksuelle kan være ledere, herunder kirkens diakon, og Calvary Baptist Church i DC, en anden medlemsforsamling, gennemfører ægteskaber mellem personer af samme køn. Desuden var CBF medsponsor for en konference om seksualitet og tog initiativ til “‘Illumination Project’, der er godkendt af bestyrelsen (tidligere koordinationsrådet), med henblik på at udvikle modeller for fællesskabets fællesskab til at lufte uenigheder, ikke kun om ansættelsesforbuddet, men også om andre aktuelle emner, der splitter kirker, kirkesamfund og samfund”.