Vi begynder med en introduktion til den relevante biologi, hvor vi forklarer, hvad vi måler og hvorfor. Derefter fokuserer vi på de to vigtigste måleteknologier: næste generations sekventering og mikroarrays. Derefter går vi over til at beskrive, hvordan rådata og eksperimentelle oplysninger importeres til R, og hvordan vi bruger Bioconductor-klasser til at organisere disse data, uanset om de er genereret lokalt eller høstet fra offentlige repositorier eller institutionelle arkiver. Genomiske egenskaber identificeres generelt ved hjælp af intervaller i genomiske koordinater, og meget effektive algoritmer til beregning med genomiske intervaller vil blive undersøgt i detaljer. Statistiske metoder til afprøvning af gen-centrerede eller vej-centrerede hypoteser med data på genomskala findes i pakker som limma, og nogle af disse teknikker vil blive illustreret i forelæsninger og laboratorier.
Givet forskelligheden i vores studerendes uddannelsesmæssige baggrund har vi inddelt serien i syv dele. Du kan tage hele serien eller de enkelte kurser, der interesserer dig. Hvis du er statistiker, bør du overveje at springe de første to eller tre kurser over, og på samme måde bør du som biolog overveje at springe nogle af de indledende biologiforelæsninger over. Bemærk, at de statistiske og programmeringsmæssige aspekter af undervisningen stiger i sværhedsgrad relativt hurtigt i løbet af de første tre kurser. På det tredje kursus vil der blive undervist i avancerede statistiske koncepter som f.eks. hierarkiske modeller og på det fjerde kursus i avancerede færdigheder inden for softwareudvikling som f.eks. parallel databehandling og reproducerbare forskningskoncepter.
Disse kurser udgør to professionelle certifikater og er selvstyrende:
Dataanalyse for biovidenskab:
- PH525.1x: Statistics and R for the Life Sciences
- PH525.2x: Introduktion til lineære modeller og matrixalgebra
- PH525.3x: Statistisk inferens og modellering af eksperimenter med højt gennemløb
- PH525.4x: Analyse af højdimensionelle data
Genomisk dataanalyse:
- PH525.5x: Introduktion til Bioconductor
- PH525.6x: Case Studies in Functional Genomics
- PH525.7x: Avanceret Bioconductor
Dette kursus blev delvist støttet af NIH-tilskuddet R25GM114818.
HarvardX kræver, at personer, der tilmelder sig dets kurser på edX, overholder vilkårene i edX’s æreskodeks. HarvardX vil træffe passende korrigerende foranstaltninger som reaktion på overtrædelser af edX’s æreskodeks, hvilket kan omfatte bortvisning fra HarvardX-kurset, tilbagekaldelse af eventuelle certifikater, der er modtaget for HarvardX-kurset, eller andre retsmidler, hvis omstændighederne berettiger det. Der vil ikke blive udstedt nogen tilbagebetaling i tilfælde af korrigerende foranstaltninger i forbindelse med sådanne overtrædelser. Tilmeldte, der deltager i HarvardX-kurser som en del af et andet program, vil også være underlagt de akademiske politikker for disse programmer.
HarvardX forfølger videnskaben om læring. Ved at tilmelde dig som online-lærer på et HX-kursus deltager du også i forskning om læring. Læs vores erklæring om forskning for at få mere at vide.
Harvard University og HarvardX er forpligtet til at opretholde et sikkert og sundt uddannelses- og arbejdsmiljø, hvor ingen medlemmer af samfundet udelukkes fra at deltage i, nægtes fordelene ved eller udsættes for diskrimination eller chikane i vores program. Alle medlemmer af HarvardX-fællesskabet forventes at overholde Harvard-politikkerne om ikke-diskrimination, herunder seksuel chikane, og edX Terms of Service. Hvis du har spørgsmål eller bekymringer, bedes du kontakte [email protected] og/eller rapportere din oplevelse via edX-kontaktformularen.