OMIM Entry – * 410000 – AMELOGENIN, Y-CHROMOSOMAL; AMELY

TEKST

I forbindelse med studiet af DNA-fragmentkloner fra det menneskelige Y-kromosom fandt Nakahori et al. (1991) en klon, AMELY, som var særligt velkonserveret i pattedyrs evolution. Der blev fundet homologe sekvenser på X-kromosomet (AMELX; 300391). Sekvenserne var homologe med tidligere sekventerede cDNA-kloner fra mus og kvæg, der koder for amelogenin.

Salido et al. (1992) fremlagde beviser fra undersøgelser af tandknopper hos hanner under udvikling, at både AMGX-genet og AMGY-genet er transkriptionelt aktive. Promotorområdet og de forudsagte proteinsekvenser for begge gener blev præsenteret. Der er ikke tale om pseudoautosomale gener, da hunner, der er heterozygote for mutationer i AMGX-genet, som forårsager amelogenesis imperfecta, viser lyonisering, dvs. et mosaikmønster af emaljeanormaliteter.

Nakahori et al. (1991) identificerede 3 exons i både AMELY- og AMELX-generne.

AMELY-genet på Y-kromosomet svarer til AMELX-genet, som blev kortlagt på kromosom Xp22.3-p22.1 af Lau et al. (1989). Lau et al. (1989) henførte AMELY-genet til det pericentriske område af Y-kromosomet, muligvis Yq11, ved hybridisering til DNA fra menneske-mus-hybridceller, der indeholder forskellige deletioner af X- og Y-kromosomerne. Den mulige relation til det Y-kromosomale locus, der er postuleret for tandstørrelse, og som er kortlagt til omtrent det samme område (se 475000), er uklar.

Amelogenin-genet hos musen synes udelukkende at være placeret på X-kromosomet (Chapman et al., 1991).

Gennem deletionskortlægning, baseret på analyse af DNA fra en række XX-hanepatienter (med X-Y-ombytning) og individer med aberrant Y-kromosom, opnåede Bailey et al. (1992) resultater, der afviger fra de rapporter, der kortlægger AMELY til proximalt Yq. Deres fund af en placering på Yp kunne forsones ved at postulere eksistensen af pericentriske inversionspolymorfismer på Y i den almindelige befolkning. Denne hypotese kunne testes ved at anvende in situ-hybridisering til at undersøge AMELY’s lokalisering på Y på en stor række normale Y-kromosomer.

Faerman et al. (1995) har udviklet en følsom og pålidelig metode baseret på amplifikation af AMG-genet til kønsidentifikation i arkæologiske menneskelige levn. AMGY-allelen bærer en lille deletion i det første intron, hvilket gør det lettere at designe særskilte X- og Y-specifikke PCR-primere. Ved hjælp af metoden blev kønnet bestemt på skeletrester af 18 personer, herunder små børn, ud af 22 undersøgte fra perioder fra 200 til ca. 8 000 år siden. Kortikale og kraniale knogler samt tænder viste sig at levere tilstrækkeligt bevaret DNA.

Lattanzi et al. (2005) fandt en stor interstitiel deletion af den korte Y-arm, der omfatter AMELY-lokussen, hos 2 ikke-relaterede individer. Det ene tilfælde blev identificeret fra en prøve af 493 infertile mænd; det andet fremkom ved undersøgelser foretaget på 13.000 uselekterede fostervandsprøver fra graviditeter med mandlige fostre (hvilket indikerer en samlet prævalens på 0,008%). Lattanzi et al. (2005) kommenterede, at selv om hyppigheden af amelogenin-deletionen er lav, bør der ikke drages konklusioner om køn på grundlag af amelogenin alene i situationer, der involverer prænatal diagnose, faderskabstest eller kriminalundersøgelser.

Ved anvendelse af en kombination af STS-deletionskortlægning, haplotyping af binære markører og Y-kort tandem gentagelse og TSPY (480100)-kopiantalestimation identificerede Jobling et al. (2007) 4 forskellige klasser af deletioner, der påvirker kromosom Yp hos 45 mænd fra 12 forskellige populationer. Den mest almindelige deletionsklasse blev fundet i 41 Y-kromosomer (91%) og syntes at være forårsaget af ikke-allelisk homolog rekombination mellem det store TSPY-repeat array og en enkelt telomerisk kopi af TSPY-genet, der er placeret over 3 Mb fra arrayet. Denne deletion resulterede i tab af AMELY-, TBL1Y- (400033) og PRKY- (400008) generne, som ligger i det område, der adskiller det enkelte TSPY-gen og TSPY-repeteringsmønstret, samt i et reduceret antal TSPY-kopier. De sjældnere deletionsklasser involverede ikke det store TSPY-repeat array, men resulterede i tab af det mere telomeriske PCDH11Y-gen (400022) ud over AMELY, TBL1Y, PRKY og den enkelte telomeriske TSPY-kopi. Vedvarende og ekspanderende deletionslinjer, sammen med fænotypiske beviser, tyder på, at fraværet af disse gener ikke har nogen større skadelige virkninger.

Ved PCR-analyse fandt Bailey et al. (1992) en bemærkelsesværdig grad af bevarelse af AMELY-primere og PCR-produktstørrelse blandt de store menneskeaber og gamle verdensaber.