Der er tre mål med plante-taksonomien: identifikation, klassificering og beskrivelse af planter. Forskellen mellem disse tre mål er vigtig og ofte overset.
1.Identifikation af planter er en bestemmelse af identiteten af en ukendt plante ved at sammenligne den med tidligere indsamlede eksemplarer eller ved hjælp af bøger eller identifikationsmanualer. Identifikationsprocessen forbinder eksemplaret med et offentliggjort navn. Når et planteeksemplar er blevet identificeret, er dets navn og egenskaber kendt.
2.Klassifikation af planter er indplacering af kendte planter i grupper eller kategorier for at vise en vis sammenhæng. Videnskabelig klassifikation følger et regelsystem, der standardiserer resultaterne og grupperer på hinanden følgende kategorier i et hierarki. F.eks. er den familie, som liljerne tilhører, klassificeret som følger:
- Kongedømme: Plante
- Division:
- Riget: Magnoliophyta
- Klasse: Magnoliophyta
- Klasse: Liliopsida
- Ordning: Liliopsida
- Ordning: Liliales
- Familie: Liliaceae
- Genus: Fyrretræer, Kvikler, Mælkebøtte, Mælkebøtte m.m.
- Arter: Fyrretræer, Kvikler, Mælkebøtte, Mælkebøtte m.fl:
- Sorter: Almindelig vandhyacint, Gul stjernetistel, Purpur løssestrife, Kudzu osv.
- Sort: ……
Klassifikation af planter resulterer i et organiseret system til navngivning og katalogisering af fremtidige eksemplarer og afspejler ideelt set videnskabelige ideer om indbyrdes relationer mellem planter. Sættet af regler og anbefalinger for formel botanisk nomenklatur, herunder planter, er reguleret af den internationale kode for nomenklatur for alger, svampe og planter forkortet ICN.
3.Plantebeskrivelse er en formel beskrivelse af en nyopdaget art, normalt i form af en videnskabelig artikel, der anvender ICN-retningslinjerne. Navnene på disse planter registreres derefter på det internationale indeks for plantenavne sammen med alle andre gyldigt offentliggjorte navne.