Autoradiographie eines Southern Blot
Die Autoradiographie ist eine Klasse von Techniken, bei denen die Positionen von radioisotopenmarkiertem biologischen Material ein Autoradiogramm („Selbstbild“) ergeben. Radioisotope wie 14C, 32P, 35S emittieren Strahlung, die einen Foto- oder Röntgenfilm belichtet. Durch den Einbau von 32P in das DNS-Rückgrat oder von 35S in die schwefelhaltigen Aminosäuren lassen sich die markierten Moleküle nachweisen.
Ein Southern Blot-Filter wird in eine lichtdichte Kassette (links) gelegt und mit einem Röntgenfilm abgedeckt. Die Kassette wird verschlossen und für einige Stunden bis mehrere Tage stehen gelassen. Die mit Radioisotopen markierte DNA belichtet den Film, der nach der Entwicklung ein Muster schwarzer Streifen zeigt, die die Positionen der markierten DNA im Blot angeben. In drei der vier Ecken werden mit spezieller Tinte, die auch den Film belichtet, Ausrichtungsmarkierungen angebracht. Anhand der drei Indexmarkierungen kann der Blot mit dem Film ausgerichtet werden (bei den e-Markierungen ist nur eine Ausrichtung möglich). In einigen Experimenten kann die Ausrichtung dazu verwendet werden, eine bestimmte DNA-Bande auf dem Blot zu lokalisieren und auszuschneiden, um die DNA für weitere Experimente zu gewinnen.