Im Jahr 2003 verklagten die Anleger der Lancer-Gruppe Citco wegen der angeblich wissentlichen Verbreitung „irreführender“ Angaben zum Nettoinventarwert (NAV). Citco teilte den Anlegern schließlich mit, dass es als Verwalter der Lancer-Fonds zurücktrete, gab jedoch keine Erklärung ab. Citco wies zwar darauf hin, dass es vom Vorstand von Lancer Erklärungen zur Angemessenheit der Bewertungen eingeholt hatte, doch Richterin Shira Scheindlin schrieb: „Obwohl diese Maßnahmen zeigen, dass die Citco Group die Zahlen in Frage gestellt hat, könnten sie auch als Bemühungen der Citco Group interpretiert werden, ihre eigene Beteiligung an dem Prozess zu verschleiern“. Letztendlich einigte sich Citco mit den Anlegern.
Im Jahr 2013 verklagten drei Rentensysteme aus Louisiana, die 100 Millionen Dollar in einen Hedgefonds investiert hatten, der hohe Renditen bei geringem Risiko versprach, Citco, das das Geschäft verwaltete. In der Klage wurde behauptet, Citco habe den Rententreuhändern gesagt, dass ihre Investition an Wert gewinne, obwohl dies nicht stimmte, da Citco die Anleger über den wahren Wert der Vermögenswerte der Investition täuschte.
Im März 2015 reichten Roger Corman und seine Frau eine Klage gegen Citco ein, in der sie u. a. Verletzung der Treuepflicht, Betrug, falsche Angaben und ungerechtfertigte Bereicherung geltend machten und behaupteten, sie hätten aufgrund der unangemessenen Handlungen und Unterlassungen von Citco, dem Verwalter des Fonds, bis zu 60 Millionen Dollar verloren.
Investoren der Fairfield Greenwich Group, des größten Betreibers von „Feeder-Fonds“ für den Ponzi-Intriganten Bernard Madoff, haben in der Sache Anwar gegen Fairfield Greenwich vor dem U.S. District Court, Southern District of New York, bei Richterin Shira Scheindlin Klage gegen Citco eingereicht. Die Anleger machten geltend, dass Citco verpflichtet war, die Nettoinventarwerte der Fonds unabhängig zu berechnen und diese Zahlen den Anteilseignern zur Verfügung zu stellen, aber stattdessen: „Citco hat sich blind und rücksichtslos auf die von Madoff und den Fonds bereitgestellten Informationen verlassen, um den Nettoinventarwert der Fonds zu berechnen und zu verbreiten … obwohl diese Informationen offensichtlich falsch waren.“ Citco wurde beschuldigt, die Investitionen von Fairfield Greenwich, von denen mehr als 7 Milliarden Dollar an Bernard L. Madoff Investment Securities LLC weitergeleitet wurden, nicht ordnungsgemäß überwacht und bewertet zu haben. Die Anleger sagten, sie hätten durch die Täuschung und Nachlässigkeit von Citco große Verluste erlitten, nachdem Madoffs Schneeballsystem im Dezember 2008 aufgedeckt worden war. Im August 2015 erklärte sich Citco bereit, 125 Mio. USD zu zahlen, um die Vorwürfe auszuräumen, es habe Anleger dazu verleitet, bei der Fairfield Greenwich Group zu investieren. Der Vergleich war der größte mit einem Verwalter oder Verwahrer im Zusammenhang mit Madoffs Betrug.