Blakeman besuchte die University of Nebraska von 1984 bis 1987 und diente hauptsächlich als Backup-Quarterback für die Nebraska Cornhuskers, einschließlich der Spielzeiten 1986 und 1987 hinter dem Starter Steve Taylor.
Im Spiel von Nebraska gegen die nicht in der Rangliste geführten Colorado Buffaloes am 25. Oktober 1986 ersetzte Cheftrainer Tom Osborne Taylor im vierten Viertel durch Blakeman. Colorado beschränkte Blakeman auf 4 von 6 Abschlüssen für 37 Yards und konnte die Huskers mit 20:10 besiegen. Dies war der erste Sieg über Nebraska seit 1967 und der erste Heimsieg der Buffaloes über Nebraska seit 1960.
Blakeman spielte 1987 im Sugar Bowl, einem 30:15-Sieg über den Southeastern Conference Champion LSU.
Am 3. Oktober 1987 führte South Carolina gegen Nebraska mit 21:13, als Taylor das Spiel verließ, nachdem er sich im letzten Spielzug des dritten Viertels an der Schulter verletzt hatte. Als Ersatzspieler brachte Blakeman seinen einzigen Pass für 8 Yards an. Doch dank eines starken Laufspiels und Nebraskas Blackshirts-Defense, die zwei Turnovers erzwang und im 4. Viertel nur 9 Yards zuließ, konnten die Huskers um Blakeman herum 17 Punkte erzielen und das Spiel mit 30:21 gewinnen.
Blakeman begann auch zwei Spiele als Ersatz für den verletzten Taylor, die beide gegen die Kansas Jayhawks gewonnen wurden. Am 15. November 1986 warf er drei Touchdown-Pässe und lief für einen weiteren, als er Nebraska zu einem 70:0-Erfolg führte, der schlimmsten Niederlage in der Geschichte der Jayhawks und dem bis dahin größten Shutout von Nebraska. Und am 10. Oktober 1987 schloss Blakeman 10 von 12 Pässen für 100 Yards und einen Touchdown beim 54:2-Sieg von Nebraska über Kansas ab.