Ein Überblick darüber, wie das Gehirn rechnen kann, wird vorgeschlagen. In der Großhirnrinde werden Erinnerungen durch Langzeitpotenzierung an Synapsen von kortikalen Inputs der Schicht 1 (die Kontexte darstellen) auf Pyramidenzellen der Schicht 2/3 gespeichert, die mit dem Thalamus in einer kortiko-thalamischen Einheit (CT) verbunden sind. Die Signale, die gespeichert werden, sind die Schicht-3-Eingänge aus dem Thalamus oder anderen kortikalen Bereichen. Die Signale werden mit der Gammafrequenz gespeichert (und später abgerufen). Ein bewusster Gedanke setzt sich aus den Ausgängen von Schicht-5-Zellen in CT-Einheiten in verschiedenen kortikalen Regionen zusammen, die durch den Beitrag oszillatorischer thalamischer und kortikaler Eingänge synchron feuern. Dieser kortikale Output beeinflusst subkortikale Bereiche, um eine Bewegung zu verursachen oder daran teilzunehmen. Der kortikale Output kann im Kleinhirn gespeichert und später in einem bestimmten Kontext von den Basalganglien und dem Kleinhirn erzeugt werden. Das Gehirn kann also entweder „bewusste“ Outputs über die Großhirnrinde oder „automatische“ Outputs über die Basalganglien und das Kleinhirn erzeugen. Wenn Zusammenhänge von den Basalganglien erkannt werden, können die im Kleinhirn gespeicherten Ausgaben ausgelöst werden, und auf diese Weise können die Basalganglien komplexe Abfolgen von Ausgaben oder Bewegungen steuern. Am Arbeitsgedächtnis ist der präfrontale Kortex beteiligt, der in ähnlicher Weise die Basalganglien und das Kleinhirn nutzt. Der Hippocampus spielt eine Rolle bei der Speicherung und dem Abruf kortikaler Ergebnisse, indem er allen CT-Schleifen in verschiedenen kortikalen Bereichen eines bewussten Gedankens einzigartige Schicht-1-Kontexte zur Verfügung stellt. Bei weiterem Abruf des Gedankens können neue Schicht-1-Kontexte mit den CT-Schleifen assoziiert werden, was den Abruf ohne den hippocampalen Input ermöglicht.