Citrato (Si)-sintetasa | ||||||
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Identificadores | ||||||
Nº CE | 2.3.3.1 | |||||
Nº CAS. | 9027-96-7 | |||||
Bases de datos | ||||||
IntEnz | Vista de IntEnz | |||||
BRENDA | Entrada en la brenda | |||||
ExPASy | Vista de NiceZyme | |||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||
MetaCyc | Vía metabólica | |||||
PRIAM | Perfil | |||||
Estructuras PDB | PDB RCSB PDBsum | |||||
Gene Ontology | AmiGO / QuickGO | |||||
Search | PMC | PubMed | NCBI |
MecanismoEdit
La citrato sintasa tiene tres aminoácidos clave en su sitio activo (conocidos como la tríada catalítica) que catalizan la conversión de acetil-CoA y oxaloacetato en citrato y H-SCoA en una reacción de condensación de aldol. Esta conversión comienza con el átomo de oxígeno de la cadena lateral de carboxilato cargado negativamente de Asp-375 desprotonando el átomo de carbono alfa del acetil CoA para formar un anión enolato que a su vez es neutralizado por la protonación de His-274 para formar un intermedio enol . En este punto, el par de electrones solitario del nitrógeno épsilon en His-274 formado en el último paso abstrae el protón hidroxilo del enol para reformar un anión enolato que inicia un ataque nucleofílico en el carbono carbonilo del oxaloacetato que a su vez desprotoniza el átomo de nitrógeno épsilon de His-320. Esta adición nucleofílica resulta en la formación de citroil-CoA . En este punto, una molécula de agua es desprotonada por el átomo de nitrógeno épsilon de His-320 y se inicia la hidrólisis. Uno de los pares solitarios del oxígeno ataca nucleófilamente el carbono carbonilo de la citroil-CoA. Esto forma un intermedio tetraédrico y da lugar a la expulsión de -SCoA al reformarse el carbonilo. El -SCoA es protonado para formar HSCoA. Finalmente, el hidroxilo añadido al carbonilo en el paso anterior es desprotonado y se forma citrato.
InhibiciónEditar
La enzima es inhibida por altas proporciones de ATP:ADP y NADH:NAD, ya que las altas concentraciones de ATP y NADH muestran que el suministro de energía es alto para la célula. También es inhibida por el succinil-CoA y el propionil-CoA, que se asemeja al acetil-coA y actúa como inhibidor competitivo del acetil-CoA y como inhibidor no competitivo del oxaloacetato. El citrato inhibe la reacción y es un ejemplo de inhibición del producto.La inhibición de la citrato sintasa por análogos del acetil-CoA también ha sido bien documentada y se ha utilizado para demostrar la existencia de un único sitio activo. Estos experimentos han revelado que este sitio único alterna entre dos formas, que participan en la actividad ligasa e hidrolasa respectivamente. Esta proteína puede utilizar el modelo de regulación alostérica de la morfina.