La simulación de dinámica molecular (DM) implementada con un campo de fuerza de proteínas de última generación y un modelo de disolvente implícito es un enfoque atractivo para investigar el plegado de proteínas, uno de los problemas más desconcertantes de la biología molecular. Pero no siempre está claro hasta qué punto los campos de fuerza desarrollados independientemente de los modelos de disolventes implícitos pueden funcionar juntos para reproducir diversas estructuras nativas de proteínas y medir la termodinámica de plegado correspondiente. En este trabajo, realizamos simulaciones MD de muestreo mejorado para evaluar la capacidad de seis campos de fuerza AMBER (FF99SBildn, FF99SBnmr, FF12SB, FF14ipq, FF14SB, y FF14SBonlysc) junto con un modelo GB-Neck2 recientemente mejorado para modelar el plegamiento de dos péptidos helicoidales y dos β-hojas. Mientras que la mayoría de los campos de fuerza probados pueden producir características aproximadamente similares para conjuntos conformacionales de equilibrio y perfiles detallados de energía libre de plegado para TC10b α-helicoidal corto en un disolvente implícito, las contrapartes medidas son significativamente discrepantes en los casos de péptidos más grandes o β-estructurados (HP35, 1E0Q, y GTT). Además, las cantidades termodinámicas de plegado/desplegado calculadas sólo coinciden parcialmente con los datos experimentales. Aunque no se identificó una combinación de los campos de fuerza y el modelo implícito GB-Neck2 capaz de describir todos los aspectos de las transiciones de plegado hacia las estructuras nativas de todos los péptidos considerados, encontramos que FF14SBonlysc junto con el modelo GB-Neck2 parece ser una combinación razonablemente equilibrada para predecir las preferencias de plegado de los péptidos.