El Journal of Biomedical Informatics refleja un compromiso con los artículos de investigación originales de alta calidad, revisiones y comentarios en el área de la metodología de la informática biomédica. Aunque publicamos artículos motivados por las aplicaciones en las ciencias biomédicas (por ejemplo, la medicina clínica, la atención sanitaria, la salud de la población y la bioinformática traslacional), la revista hace hincapié en los informes de nuevas metodologías y técnicas que tienen una aplicabilidad general y que constituyen la base de la ciencia en evolución de la informática biomédica. Los artículos sobre dispositivos médicos, las evaluaciones de los sistemas implementados (incluidos los ensayos clínicos de las tecnologías de la información) o los trabajos que proporcionan información sobre un proceso biológico, una enfermedad específica o las opciones de tratamiento serían, por lo general, más adecuados para su publicación en otros lugares. Los trabajos sobre aplicaciones de procesamiento de señales y análisis de imágenes suelen ser más adecuados para revistas de ingeniería biomédica u otras revistas de informática, aunque publicamos trabajos que hacen hincapié en la gestión de la información y en las cuestiones de representación/modelado del conocimiento que surgen en el almacenamiento y uso de señales e imágenes biológicas. Las descripciones de sistemas son bienvenidas si ilustran y fundamentan la metodología subyacente que es el foco principal del informe y se hace un esfuerzo por abordar la generalizabilidad y/o el rango de aplicación de esa metodología. Tenga en cuenta también que, dada la naturaleza internacional del JBI, los artículos que tratan de idiomas específicos distintos del inglés, o de sistemas o enfoques de salud específicos de un país, son aceptables para el JBI sólo si ofrecen lecciones generalizables que sean relevantes para el amplio público del JBI, independientemente de su país, idioma, cultura o sistema de salud.
¿Qué artículos son apropiados para el JBI?
Trabajos que respondan a una necesidad en medicina, no sólo un conjunto de datos convenientes para analizar con métodos novedosos, que podrían ir a una revista de ingeniería en su lugar.
La participación de los profesionales de la salud en la motivación del trabajo y la evaluación de los resultados es normalmente necesaria.
Alentamos a los autores del JBI de trabajos de investigación originales a que describan trabajos como los siguientes:
«Tenía un problema biomédico del mundo real, probé las técnicas existentes pero no funcionaron. Así que desarrollé una nueva metodología y evalué su idoneidad y la comparé con el estado del arte en mi dominio del mundo real. Esto me hizo pensar en qué otros problemas podría ayudar a resolver este nuevo método. Me relacioné con esto en la Discusión y demostré que tengo una nueva metodología genérica que no es específica para un dominio de aplicación estrecho.»
«Aunque he utilizado métodos de ML existentes, he creado y validado un ‘método de métodos’ que explica cómo aplicar los métodos existentes a un espacio de problemas biomédicos que comparten características únicas que influyen en la elección de los métodos.»
¿Qué es la informática biomédica?
«La informática biomédica es el campo interdisciplinario que estudia y persigue los usos efectivos de los datos, la información y el conocimiento biomédico para la investigación científica, la resolución de problemas y la toma de decisiones, motivados por los esfuerzos para mejorar la salud humana.»
C A Kulikowski et al, AMIA Board white paper: definition of biomedical informatics and specification of core competencies for graduate education in the discipline, Journal of the American Medical Informatics Association, vol. 19, no. 6, pp. 931-938, November 2012.
¿Qué áreas de la informática biomédica están fuera del alcance del JBI?
Los artículos sobre procesamiento de señales, imágenes, dispositivos médicos, redes de comunicación, seguridad suelen estar fuera del alcance del JBI; incluso los artículos de bioinformática/modelado de enfermedades podrían estar fuera del alcance. Para ser considerados para el JBI, todos estos artículos deben introducir métodos informáticos novedosos que se basen en una profunda comprensión y utilización del conocimiento del dominio médico y deben ser traducibles en aplicaciones médicas. Ejemplos de trabajos que no encajarán son los que predicen la estructura de las secuencias de ADN (no son traslacionales) o los trabajos de modelización de la transmisión de enfermedades que no demuestran una comprensión y utilización de la epidemiología de las enfermedades infecciosas o que no son aplicables en la práctica.
Los métodos en los que se centran los artículos del JBI pueden proceder de cualquiera de las ciencias que componen el campo de la informática biomédica. Aunque los métodos están a menudo relacionados con el campo de la informática, muchos artículos del JBI enfatizarán técnicas innovadoras de otros campos, tales como la ciencia de la decisión, la estadística, la ciencia cognitiva, la psicología, la ciencia de la información, la teoría de la organización o la ciencia de la gestión.
Si está considerando su artículo sobre bioinformática para enviarlo al JBI, por favor, tenga en cuenta este enfoque metodológico. Los descubrimientos biológicos basados en el uso de técnicas informáticas rutinarias pueden ser importantes contribuciones biológicas pero no son adecuadas para el JBI. Además, tenga en cuenta que el JBI publica artículos de bioinformática sólo si tratan temas de ciencia traslacional (humana). Consulte el editorial de Bioinformática Traslacional que trata este tema antes de enviar su artículo.
Los artículos sobre privacidad o seguridad biomédica también deben ofrecer metodologías nuevas y prácticas que estén claramente motivadas por los retos de la atención sanitaria y la biomedicina. Un método establecido de otro campo no justifica su publicación en el JBI simplemente porque se haya aplicado a un problema biomédico. También buscamos artículos que describan una novedad metodológica sustancial en lugar de pequeñas mejoras incrementales sobre técnicas previamente publicadas. Vea nuestro editorial de Privacidad y Seguridad para más detalles sobre nuestras políticas para los artículos aceptables en esta área.
Los artículos son generalmente de siete tipos:
1. Artículos de investigación regulares: Presentación y discusión de un sistema o enfoque con motivación biomédica o clínica que ha requerido el desarrollo de métodos innovadores más que la aplicación de técnicas establecidas. Se pueden discutir las aplicaciones motivadoras, pero el nuevo método debe ser discutido de manera que la generalizabilidad sea clara, idealmente con una evaluación de su rango de aplicabilidad. Por favor, elija el tipo de artículo «Research Paper» durante el proceso de envío.
2. Artículos de revisión metodológica: Revisiones de un enfoque metodológico que resumen su introducción, uso, éxitos y limitaciones. Estas revisiones también propondrán a menudo futuras direcciones de investigación o criticarán un método y discutirán la gama de problemas para los que puede no ser una solución apropiada. Tenga en cuenta que estas revisiones deben centrarse en un método o enfoque, no en un ámbito de aplicación específico (por ejemplo, evite enviar revisiones como «Computers in Diabetes Management»). Por favor, elija el tipo de artículo «Review article» durante el proceso de envío.
3. Comentarios: Se trata de artículos, generalmente más breves que los de investigación, que tienden a discutir artículos previamente publicados o un tema que es un área importante de enfoque para la base metodológica de la investigación informática biomédica y su aplicación. Los comentarios suelen ser invitados, pero pueden ser presentados por cualquier persona tras una discusión con los editores. Si se está considerando la presentación de un comentario, por favor, envíe previamente una breve propuesta a [email protected]. Si su presentación de un Comentario ha sido solicitada, o aprobada por el editor, por favor elija el tipo de artículo «Discusiones» durante el proceso de presentación y especifique en la carta de presentación que su manuscrito está destinado a ser un Comentario.
4. Comunicaciones especiales:Son artículos que abordan un tema de amplio interés para la comunidad de investigación informática orientada a la metodología. Pueden informar sobre los resultados de talleres o estudios de investigación, generalmente ofreciendo lecciones u orientaciones que serán útiles para otros. No es necesario que estos artículos informen sobre nuevas metodologías informáticas innovadoras. Si se está considerando la presentación de una comunicación especial, por favor, envíe previamente una breve propuesta a [email protected]. Si su presentación de una comunicación especial ha sido aprobada por el editor, elija el tipo de artículo «Discusión» durante el proceso de presentación y especifique en la carta de presentación que su manuscrito está destinado a ser una comunicación especial.
5. Cartas al editor: Se pueden presentar cartas que serán consideradas para su posible publicación en la revista. Suelen comentar un artículo previamente publicado. Por favor, elija el tipo de artículo «Correspondencia» durante el proceso de envío.
6. Reseñas de libros: Los editores identificarán ocasionalmente un nuevo libro que pueda ser de interés para los lectores del JBI. Invitarán a personas a escribir reseñas de estos volúmenes, y tales envíos son sólo por invitación. No se considerarán las reseñas de libros no solicitadas. Por favor, elija el tipo de artículo «Reseña de libro» durante el proceso de envío.
7. Editoriales: Los editores o sus invitados publicarán ocasionalmente editoriales, pero no se considerarán los editoriales no solicitados. Por favor, elija el tipo de artículo «Editorial» durante el proceso de presentación.
Cuando un autor presenta un manuscrito en respuesta a una convocatoria de artículos para un número temático especial, la categoría de presentación debe ser el título del número especial, pero la carta de presentación debe indicar si el artículo es una revisión metodológica, un artículo regular o un comentario.
Antecedentes para revisar antes de enviar un artículo
El Journal of Biomedical Informatics (JBI), publicado por primera vez por Academic Press en 1968 bajo el título Computers and Biomedical Research (CBR), fue rediseñado y renombrado a partir del volumen 34 en 2001. Sobre la base de una sólida historia de 33 años desde que CBR se estrenó en 1968, hicimos una serie de cambios para actualizar y reorientar la revista a la luz de la evolución del campo, mientras que simultáneamente tratamos de llenar un nicho no claramente identificado como un enfoque central por las otras revistas que publican artículos en la investigación informática biomédica. En nuestro editorial inaugural, expresamos ese objetivo de la siguiente manera:
«Cada vez es más difícil publicar artículos que tengan un amplio atractivo para un público diverso. En consecuencia, hemos decidido que es importante introducir un enfoque más estricto en la revista en los próximos años, y es con esto en mente que hemos cambiado el nombre de la revista para reflejar un énfasis más moderno y estrecho. El Journal of Biomedical Informatics (JBI) pretende complementar, más que competir, con las demás revistas importantes de informática biomédica. En particular, deseamos enfatizar los artículos que dilucidan las metodologías que se generalizan a través de los dominios biomédicos y que ayudan a formar la base científica para el campo. Los artículos tenderán a referirse a la tecnología de la información más que a los dispositivos médicos, y a los métodos subyacentes más que a las descripciones de los sistemas o a las evaluaciones sumarias. Debe esperar que esta revista sea una excelente fuente de nuevas ideas sobre cómo abordar los problemas difíciles que surgen en el desarrollo de soluciones computacionales a los problemas de las ciencias biomédicas y la práctica clínica»
Con casi dos décadas de publicación bajo el título del JBI, estamos satisfechos por el éxito de la revista. Tiene una reputación de excelencia y rigor y esperamos que nuestros lectores y autores publicados estén igualmente impresionados por la calidad tanto de los trabajos como de los escritos que hemos atraído a estas páginas.
JBI busca publicar artículos que hagan una contribución conceptual al campo, típicamente describiendo una innovación en metodología o técnica o discutiendo lecciones sustantivas generalizables que han sido aprendidas en el contexto de un proyecto informático interesante. Cuando una contribución tiene una base teórica, esa teoría es también un énfasis apropiado para la exposición. Según nuestra experiencia, muchos proyectos de investigación que comienzan como esfuerzos de aplicación resultan en una innovación metodológica que, debidamente descrita, contribuye a la base científica de nuestra disciplina. Por lo tanto, no desalentamos las presentaciones que discuten aplicaciones interesantes, sino que fomentamos una perspectiva sobre la mejor manera de escribir y compartir conocimientos metodológicos generalizables que se derivan del trabajo aplicado y de los que otros pueden beneficiarse. Creemos que este tipo de artículos forman el núcleo de la informática biomédica como ciencia.
Ha habido cinco razones principales para devolver artículos sin revisar. Tal vez la más común ocurre cuando un artículo es principalmente una descripción de una aplicación informática o su evaluación. Un nuevo sistema clínico que aborda un problema clínico importante, pero que no ofrece una metodología novedosa, sería más apropiado para otra revista, ya sea de informática aplicada o del ámbito clínico de aplicación. Del mismo modo, los estudios de encuestas/cuestionarios o los análisis de las necesidades de los usuarios son probablemente adecuados para el JBI sólo si aportan nuevos métodos para la realización de dichos estudios o análisis, o nuevos conocimientos sobre el comportamiento de los usuarios, la ciencia cognitiva o la interacción entre el ser humano y el ordenador.
Una segunda razón para devolver los artículos sin revisar se produce cuando un artículo no se ocupa de las nociones básicas de la informática de la gestión de la información y el conocimiento. Lo más habitual es que esto ocurra cuando un artículo presenta un nuevo dispositivo médico o un enfoque para el procesamiento de señales o imágenes biomédicas, especialmente cuando el énfasis se pone en los métodos numéricos o la monitorización fisiológica en lugar de en el procesamiento y la gestión de la información o los enfoques basados en el conocimiento. Por lo general, remitimos estos artículos a revistas de ingeniería biomédica o a revistas clínicas del ámbito de aplicación (por ejemplo una revista de cardiología para nuevos enfoques en el análisis de electrocardiogramas, o una revista de imagen para un nuevo enfoque matemático en la segmentación u otros aspectos del análisis de imágenes).
En tercer lugar, debido a que el campo de la informática biomédica está motivado a través de todas las aplicaciones para tener un impacto positivo en la salud humana o en el tratamiento de las enfermedades humanas, los artículos de bioinformática presentados al JBI deben estar en el área de la bioinformática traslacional (TBI). Rechazamos rutinariamente artículos sin revisión si tratan de soluciones bioinformáticas básicas que son ampliamente aplicables (por ejemplo, métodos analíticos para microarrays) pero que no están específicamente motivados por la salud o la enfermedad humana. En consecuencia, no publicamos artículos que traten de bioinformática vegetal o animal o de métodos genómicos específicamente destinados a la agricultura o la zoología.
En cuarto lugar, utilizamos un software de apoyo para evaluar cada envío al JBI, buscando si hay evidencia de reutilización significativa del texto de otros artículos publicados. En algunos casos, las publicaciones anteriores ni siquiera se citan en el nuevo trabajo. Independientemente de que los autores de un manuscrito sean también los autores de un artículo del que se ha reutilizado el texto, por lo general nos negamos a revisar los artículos que tienen un solapamiento significativo con otras publicaciones. Este tipo de prácticas no sólo suscitan preocupaciones de plagio (o autoplagio), sino que también plantean dudas sobre la novedad del trabajo presentado en el nuevo manuscrito. Esperamos que todos los trabajos sean escritos de novo y pedimos que los manuscritos (y la carta de presentación) dejen claro cómo el nuevo trabajo se basa en, mejora o supera las capacidades del trabajo publicado anteriormente.
Por último, aunque el JBI es una revista internacional y entendemos los retos a los que se enfrentan los autores cuando el inglés no es su lengua materna, algunos artículos tienen problemas tan graves con su exposición en inglés que los rechazamos o los devolvemos para su revisión, sugiriendo la participación de un editor o coautor experto en inglés antes de que el artículo pueda ser juzgado adecuado para entrar en el proceso de revisión científica. Los problemas menores de lenguaje pueden corregirse en el proceso editorial, pero los más graves impiden una evaluación adecuada de la contribución científica.
De los trabajos que se han sometido a revisión, nuestra tasa de aceptación final es ahora de aproximadamente el 25%. Todos los trabajos publicados han sido aceptados sólo después de importantes revisiones, por lo que los autores no deben sorprenderse cuando se requieren revisiones antes de que un trabajo esté listo para su publicación. Sin embargo, creemos que el rigor que hemos introducido en el proceso de examen y revisión ha dado lugar a un producto mejor y más útil desde el punto de vista científico. Por ejemplo, los comentarios anecdóticos, así como los datos de citas y descargas, sugieren que las revisiones metodológicas incluidas en casi todos los números han sido ampliamente utilizadas con fines educativos y de estudio.
Hemos recibido un número creciente de artículos presentados en cada año desde la transición de CBR a JBI. En nuestro primer año recibimos unos 100 manuscritos, pero ahora recibimos más de 800 trabajos al año. Como resultado, la revista ha crecido en tamaño, con más artículos por número. También dedicamos dos o tres números al año a temas metodológicos especiales supervisados por editores invitados que nos proponen dichos números especiales. Los artículos aceptados se publican inmediatamente en línea y se indexan en Medline. Poco después aparecen en un número «virtual» compilado en ScienceDirect. Desde 2016 hemos dejado de producir una versión impresa de JBI, habiendo aprendido que la gran preponderancia del acceso a la revista es a través de Internet y ScienceDirect. Las copias impresas de los números completos están disponibles en Elsevier a través de los servicios de impresión bajo demanda. Los artículos pueden publicarse en acceso abierto mediante el pago de una cuota por parte de los autores, pero por lo demás sólo están disponibles para los suscriptores durante los primeros 12 meses tras la publicación. A partir de entonces, se abren al acceso libre en nuestro archivo abierto de ScienceDirect. Debido a que la revista se produce sólo en línea, no hay límite o cargo en cuanto al uso de color en las figuras o fotografías en los manuscritos presentados.
Le animamos a enviar sus mejores trabajos metodológicos al JBI. Tenga en cuenta que proporcionamos oportunidades para la discusión en profundidad de un enfoque innovador, a juicio de nuestros revisores así como de los editores, y hemos evitado cualquier límite arbitrario en el número de palabras u otras métricas relativas a la longitud de los artículos individuales. También alentamos los artículos que describen trabajos de tesis doctorales, y destacamos que las extensas revisiones de temas realizadas en un documento de tesis a menudo pueden adaptarse para desarrollar un artículo de revisión metodológica que sea adecuado para el JBI. La revista tampoco tiene cargos por página y puede incluir componentes multimedia para los artículos en el entorno online.
La informática biomédica es un campo floreciente, con importantes aplicaciones e implicaciones en todo el mundo biomédico y clínico. Estamos deseosos de que la comunidad investigadora identifique sistemáticamente al JBI como la revista que mejor define la base científica de este campo. En consecuencia, invitamos tanto a sus contribuciones como a sus lectores.
Mor Peleg
Editor Jefe
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