Academic Dynasties: meet the Nussenzweigs

Professoreiden lapsista tulee usein itsekin professoreita, miten selittää tämä? No, Se on yksinkertaista tiedettä, kuten Edinburghin tutkijat Ian Dearyn ja Stuart Ritchien ympärillä todettiin vertaisarvioidussa tutkimuksessa: Paras tieteellinen todiste on, että a) Englannin poliittinen eliitti ja aatelisto ovat kaikki erittäin älykkäitä ja b) pienituloisten perheiden lapset, erityisesti maahanmuuttajien ja tummaihoisten lapset, pääsevät harvoin Oxbridgeen. Molemmilla on hyvät tieteelliset syyt.

Tältä osin on aika suoraviivaista, miksi yllättävän monella professorilla on professori-isä ja joskus myös professori-äiti. Joskus samassa yliopistossa, jossa heidän geneettisesti ylivertainen ja älykkyysosamäärällä varustettu jälkikasvunsa on sattunut opiskelemaan, tai jopa ottamaan oman tiedekunnan professuurin. Joskus riittää, että sanoo sukunimensä ja myöntää, että kyllä, se ja se on todellakin isäni, äitini tai setäni, ja kaikki akateemiset ovet avautuvat kuin taikaiskusta.

Lukijani saattavat muistaa kaksi tällaista esimerkkiä. MIT:n molekyylibiologi David Sabatini varjosti pitkään akateemista isäänsä David Sabatini senioria, itse asiassa juniori on niin suuri ja vaikutusvaltainen, että hänen ei luultavasti koskaan tarvitse perua paperia, vaikka mikä olisi. Hyvin erilainen tapaus on Yhdysvalloissa asuvan kreikkalaisen materiaalitutkijan Katerina Aifantisin ja hänen isänsä Elias Aifantisin tapaus, joka on niin kieroutunut, että jopa paatuneiden psykiatrien ryhmä luultavasti lopettaa hiusten repimisen.

Seuraava tapaus on Nussenzweigin perheen tapaus, jossa ainakin yhdelle pojista, Rockefellerin yliopiston immunologian professorille, HIV-tutkijalle, AAAS:n ja NAS:n jäsenelle Michel Nussenzweigille, ”vaihtoehtoinen ura” voisi olla parempi vaihtoehto. PubPeerissä on juttuja, jotka ainakin viittaavat siihen. Osa näistä papereista julkaistiin yhdessä hänen veljensä Andre Nussenzweigin kanssa, joka on syöpätutkija Bethesdassa sijaitsevassa NIH:n kansallisessa syöpäinstituutissa (National Cancer Institute, NCI).

Heidän vanhempansa olivat Ruth ja Victor Nussenzweig (molemmat nyt kuolleet), erittäin arvostettuja brasilialaisia immunologeja, jotka vuonna 1963 pakenivat fasistidiktatuuria ja asettuivat New Yorkin yliopistoon (Ruth Nussenzweig pakeni vuonna 1939 natseja Itävallasta). Heidän poikansa Michel opiskeli, valmistui ja rakensi koko akateemisen uransa naapurissa sijaitsevassa Rockefeller-yliopistossa, jossa hänen tiedekuntansa professuuri on nimetty hänen kahden kuuluisan tohtorintutkinnon ohjaajansa, Zanvil Cohnin ja Ralph Steinmanin mukaan. Nyt Michel Nussenzweig työskentelee tuoreessa Nature-julkaisussa COVID-19:n parantamisen parissa tutkimalla virusta neutraloivia vasta-aineita.

Nussenzweigin lähestymistapa immunoglobuliinien rekombinaatioon on toistaiseksi osoittautunut riemukkaaksi menestykseksi, ja artikkeleita on vasaroitu Natureen, Celliin ja Scienceen. Jos se toimi siellä, se saa varmasti myös koronaviruksen hakatuksi kuin vastahakoinen vertaisarvioija.

Aloitetaanpa Michelin laboratoriosta peräisin olevalla artikkelilla, joka on kirjoitettu yhdessä hänen veljensä ja DNA:n korjauksen asiantuntijan Andre Nussenzweigin kanssa.

Tämä näyttää uudelleenkäytetyltä geeliltä ja edustaa kahta eri koetta, joissa käytettiin kahta eri proteiinikonstruktiota. Ehkä erehdys, jossa joku myös vahingossa rajasi nauhat virheellisesti kopioidessaan niitä virheellisesti.

Lisätapaturmia Michelin Rockefellerin laboratoriosta, jälleen hänen veljensä kanssa kirjoittajakumppanina, jossa yksi edellä mainitun paperin kirjoittajakumppaneista palaa tässä ensimmäiseksi kirjoittajaksi:

Niklas Feldhahn, Elisabetta Ferretti, Davide F Robbiani, Elsa Callen, Stephanie Deroubaix, Licia Selleri, Andre Nussenzweig, Michel C Nussenzweig The hSSB1 orthologue Obfc2b is essential for skeletogenesis but dispensable for the DNA damage response in vivo The EMBO journal (2012) doi: 10.1038/emboj.2012.247

Niklas Feldhahn on nyt luennoitsija Lontoon Imperial Collegessa. Vuonna 2006 hänen väitöskirjansa Kölnin yliopistosta Saksasta (Feldhahn et al JEM 2002) vedettiin takaisin ”virheellisten FACS-instrumenttikompensaatioiden” vuoksi, toinen Feldhahnin yhdessä kirjoittama artikkeli, Klein et al JEM 2004, on toistaiseksi välttynyt kirjallisuuskorjauksilta. Feldhahn tai kukaan Nussenzweig ei ole vielä ehtinyt vastata. Tämä Nussenzweigien Nature-paperi saattaa olla vielä ongelmallisempi:

On melko selvää, että kaksi leimattua kaistaa ovat identtiset. Voiko tämä tapahtua vahingossa tai vahingossa? Riippuu miten määrittelet vahingon tai erehdyksen, ehkä kuten kiinni jääminen tietojen väärentämisestä? Tällä kertaa Andre Nussenzweig on viimeinen ja vastaava kirjoittaja. Mutta kumpikaan veljeksistä ei ole toistaiseksi vastannut PubPeerissä, vaikka he ovatkin ensisijaisesti vastuussa vanhemmista kirjoittajista. Tässä saattaa olla jokin kaava, huomaa, että vuoden 2001 Nature-artikkelin toinen kirjoittaja on vuoden 2002 Cell-artikkelin ensimmäinen kirjoittaja:

Tämän pääkirjoittaja Rafael Caselas on nyt johtava tutkija National Cancer Institutessa (NCI) NIH:ssa Bethesdassa, jossa Andre Nussenzweig työskentelee. Caselas julkaisi myös tämän yhdessä mentorinsa Michel Nussenzweigin kanssa:

Tämä kepponen ei ollut kiva juttu tälle paperille, vieläpä Science-lehdessä, ja vieläpä tällaisen yhteistyökumppanin kanssa. Saksalainen tiedemies Klaus Rajewsky, syntynyt 1936, on genetiikan ja immunologian legendaarinen titaani, hänen nimensä avaa kaikki akateemiset ovet ja lehtien portit. Hänen poikansa Nikolaus Rajewsky on myös menestynyt melko hyvin genetiikan alalla, kuten akateemiset dynastiat toimivat, kaikki on geneettistä älykkyysosamäärän periytymistä, tiedättehän. Isä ja poika Rajewsky korjasivat vuonna 2017 yhteisen Cell-artikkelinsa Xiao et al. 2007 ”FACS-plotin päällekkäisyyden” vuoksi. Tilanne vaikuttaa hieman samankaltaiselta kuin Caselas et al 2001 paperissa, koska Rajewskyt selittivät korjauksessa:

”Pienet erot prosenttiosuuksissa kahdessa paneelissa oikealla johtuvat päivitetystä FlowJo-ohjelmistosta.”

Toivottavasti Rajewskyt haastoivat oikeuteen nuo tuhmat FlowJo-ohjelmiston tekijät tai ainakin poistivat tuon pahan päivityksen. Joka tapauksessa ei todellakaan ole miellyttävää löytää Klaus Rajewskin papereista todisteita datan manipuloinnista, varsinkin kun oli jo se edellä mainittu vuoden 2006 retkahdus kölniläisen Feldhahnin kanssa, joka siihen mennessä oli jo lähtenyt USA:han työskentelemään Michel Nussenzweigin kanssa.

Ei Feldhahnia tai Caselasia seuraavassa Michel Nussenzweigin ja Klaus Rajewskin yhteisessä paperissa kuitenkaan:

Yair Dorsett, Kevin M. McBride, Mila Jankovic, Anna Gazumyan, To-Ha Thai, Davide F. Robbiani, Michela Di Virgilio, Bernardo Reina San-Martin, Gordon Heidkamp, Tanja A. Schwickert, Thomas Eisenreich, Klaus Rajewsky, Michel C. Nussenzweig MicroRNA-155 suppresses activation-induced cytidine deaminase-mediated Myc-Igh translocation Immunity (2008) doi: 10.1016/j.immuni.2008.04.002

Paha uutinen on, että kuvat eroavat kirkkaudeltaan/kontrastiltaan, vaikka niissä näytetään täsmälleen samaa geeliskannausta, joka ikinen täplä taustasta täsmää. Miksi joku säätäisi kirkkautta, kun vahingossa kopioi-kopioi kuvan? Hyvä uutinen on se, että seuran julkaisema Journal of Immunology on melkoinen huijaustehdas, joka päästää paljon pahempia asioita liukumaan, paljon vähemmän tärkeille ihmisille.

Mutta palataanpa vielä lyhyesti pahaan virtaussytometriaohjelmistoon, joka tehtailee erilaisia lukuja identtisille FACS-ploteille. Tässä on nimittäin täytynyt tapahtua juuri näin:

Ensimmäinen kirjoittaja Dimitris Skokos teki suuren uran lääketeollisuudessa ja on Rockefellerin yliopiston apulaisprofessori. Hän kouluttautui siellä saman mentorin alaisuudessa kuin Michel Nussenzweig, ilmeisesti Nobelisti Ralph Steinman opetti heitä, sitaatti:

”Tee kaikkesi toteuttaaksesi ensimmäisen tieteellisen havaintosi. Älä koskaan kuuntele ihmisiä, joilla ei ole mielikuvitusta. Tee vain parhaasi.”

Jotkut Steinmanin alaikäisistä ottivat hänen neuvonsa ilmeisesti liian kirjaimellisesti.

Seuraava tapaus on vain identtisesti monistettu kuva, joka ei sinänsä merkitse juuri mitään. Mutta näyttää siltä, että Michel Nussenzweigin laboratoriossa Rockefellerissa tapahtuu toistuvasti vahingossa tällaisia tai pahempia asioita.

Sergey Yurasov , Hedda Wardemann, Johanna Hammersen, Makoto Tsuiji, Eric Meffre, Virginia Pascual, Michel C. Nussenzweig Defective B-solujen toleranssitarkistuspisteet systeemisessä lupus erythematosuksessa The Journal of Experimental Medicine (2005) doi: 10.1084/jem.20042251

Mutta nyt artikkeli ilman Micheliä, mutta Andre Nussenzweigin kanssa. Joka jostain syystä päätti olla korjaamatta kirjallisuutta tässä:

Longyue L Cao, Xioaling Xu, Samuel F. Bunting, Jie Liu, Rui-Hong Wang, Longyue L. Cao, J. Julie Wu, Tie-Nan Peng, Junjie Chen, Andre Nussenzweig, Chu-Xia Deng, Toren Finkel A selective requirement for 53BP1 in the biological response to genomic instability induced by Brca1 deficiency Molecular Cell (2009) doi: 10.1016/j.molcel.2009.06.037

Molecular Cellin toimittajia siteerataan PubPeerissä yli kahden vuoden takaa seuraavasti: ”It was investigated and handled according to our Process for Post Publication Issues”. Mitään toimenpiteitä ei ole tehty tämän paperin suhteen tähän päivään mennessä. Viimeisellä kirjoittajalla, Toren Finkelillä Pittsburghin yliopistosta, on useita julkaisuja Pubpeerissa, yksi hänen laboratorionsa julkaisu (Narayan et al Nature 2012) peruttiin takaisin, virallisesti sen vuoksi, että se ei ollut toistettavissa.

Oliko Nussenzweigin veljesten todella tarpeen ryhtyä vanhempiensa kaltaisiksi tiedemiehiksi, joilla on tuollainen asenne tietojen eheyttä kohtaan? Totta kai, juuri näin biolääketiede etenee yhdestä Nature-paperista toiseen NIH-apurahaan. Ja näin Michel Nussenzweig parantaa COVID-19:n Nature-julkaisuilla.