CAZy

Tämä artikkeli koskee tietokantaa. Yhdyskunnasta Yhdysvalloissa, katso Cazy, Länsi-Virginia.

CAZy on tietokanta hiilihydraattiaktiivisista enZYmeistä (CAZymes). Tietokanta sisältää luokituksen ja siihen liittyvää tietoa entsyymeistä, jotka osallistuvat monimutkaisten hiilihydraattien eli disakkaridien, oligosakkaridien, polysakkaridien ja glykokonjugaattien synteesiin, metaboliaan ja tunnistamiseen. Tietokanta sisältää glykosidihydrolaasiperheet, glykosyylitransferaasit, polysakkaridilyaasit, hiilihydraattiesteraasit ja ei-katalyyttiset hiilihydraatteja sitovat moduulit. CAZy-tietokanta sisältää myös lignoselluloosan hajottamiseen osallistuvien Auxiliary Activity redox -entsyymien luokituksen.

CAZy

Database.png

Sisältö

Kuvaus

hiilihydraattiaktiivisia entsyymejä koskeva tietokanta

Yhteystiedot

Tutkimuskeskus

AFMB, Ranskan kansallinen tieteellinen tutkimuskeskus

Laboratorio

Glykogenomics group

Primary citation

Lombard & al. (2014)

Access

Website

http://www.cazy.org/

Tools

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy perustettiin vuonna 1999, jotta CAZy:n proteiinisekvensseihin perustuva CAZymes-perheiden sukujen luokittelu olisi saatavilla verkossa ja sitä voitaisiin päivittää jatkuvasti, joka kehitettiin alun perin 1990-luvun alussa glykosidihydrolaasien luokittelua varten. Uudet merkinnät lisätään pian sen jälkeen, kun ne ilmestyvät GenBankin päivittäisiin julkaisuihin. DNA-sekvensoinnin nopea kehitys on johtanut CAZy-tietokannan räjähdysmäiseen kasvuun, ja se kattaa nyt satoja tuhansia sekvenssejä. CAZy-tietokantaa kuratoi ja kehittää edelleen Ranskan kansallisen tieteellisen tutkimuskeskuksen ja Aix-Marseillen yliopiston yhteydessä toimivan AFMB:n Glycogenomics-ryhmä.

CAZy-tietokantaan on liitetty CAZypedia, joka otettiin käyttöön vuonna 2007 tutkimusyhteisölähtöisenä, wikipohjaisena CAZy-tietosanakirjana.

Jätä kommentti