Centimorgan (lyhenne cM, nimetty Thomas Hunt Morganin mukaan) on genetiikan apumittayksikkö, joka ilmaisee rekombinaation frekvenssin tai todennäköisyyden prosentteina. Tällä tavoin voidaan kvantifioida geneettinen etäisyys eli kromosomissa olevien kahden lokuksen välinen geneettinen etäisyys.
Samassa kromosomissa sijaitsevat geenit voidaan ”irrottaa” risteytymällä. Näiden risteytymistapahtumien odotettu lukumäärä voidaan arvioida (havaitun) rekombinaatiotaajuuden perusteella.
Kaksi lokusta ovat 1 cM:n päässä toisistaan, jos rekombinaatio (ts. risteytymisen) todennäköisyys näiden lokusten välillä on 1 % meioosia kohti, eli keskimäärin yksi risteytyminen tapahtuu 100 meioosissa:
R e k o m b i n a t i o n = 100 ⋅ T h e r e k o m b i n a t i o n {\displaystyle \mathrm {rekombinaatio\,} =100\cdot {\frac {\mathrm {\mathrm {luku\;of\;rekombinantti\;sukusolut} }{{\mathrm {gametes;yhteensä} }} 
(zygootin muodostumiseen tarvitaan kaksi sukusolua, joiden molempien muodostuessa on saattanut tapahtua rekombinaatio).