Giovanni Alfonso Borelli, alkuperäinen nimi Giovanni Francesco Antonio Alonso, (syntynyt 28.1.1608, Napoli, Napolin kuningaskunta -kuollut 12.12.1608). 31, 1679, Rooma), italialainen fysiologi ja fyysikko, joka selitti ensimmäisenä lihasten liikkeet ja muut kehon toiminnot staattisten ja dynaamisten lakien mukaisesti.
Hänet nimitettiin Messinassa matematiikan professoriksi vuonna 1649 ja Pisassa vuonna 1656. Vuonna 1667 hän palasi Messinaan ja lähti vuonna 1674 Roomaan, jossa hän asui Ruotsin entisen kuningattaren Kristiinan suojeluksessa. Hänen tunnetuin teoksensa on De Motu Animalium (1680-81; ”Eläinten liikkeistä”), jossa hän pyrki selittämään eläinkehon liikkeet mekaanisin periaattein; hän lukeutuu siten iatrofyysisen koulukunnan perustajiin.
Borelli kirjoitti myös monia tähtitieteellisiä teoksia, muun muassa vuonna 1666 julkaistun tutkielman, jossa hän pohti vetovoiman vaikutusta Jupiterin satelliitteihin. Vuonna 1665 julkaistussa kirjeessä, joka julkaistiin salanimellä Pier Maria Mutoli, hän esitti ensimmäisenä ajatuksen, että komeetat kulkevat parabolista rataa.