Kookoslaatta syntyi merenpohjan levittäytyessä Itä-Tyynenmeren kohouman ja Kookosharjun varrella, erityisesti monimutkaisella alueella, jota geologit kutsuvat Kookos-Nazca-levitysjärjestelmäksi. Nostumasta levy työntyy itään ja työntyy tai raahautuu (ehkä molempia) vähemmän tiiviin Karibian levyn alle prosessissa, jota kutsutaan subduktioksi. Subduktoitunut etureuna lämpenee ja lisää vettä yläpuolella olevaan vaippaan. Astenosfääriksi kutsutussa vaippakerroksessa vaippakivi sulaa magmaksi, jolloin ylikuumentunut vesi jää loukkuun suuren paineen alle. Tämän seurauksena subduktoituvan reunan koillispuolella on Costa Ricasta Guatemalaan ulottuva yhtenäinen tulivuorten kaari, joka tunnetaan myös nimellä Keski-Amerikan tulivuorikaari, ja maanjäristysvyöhyke, joka ulottuu pohjoisemmaksi, Meksikoon.
Kookoslaatan pohjoisraja on Keski-Amerikan kaivanto. Itäraja on muuntautumishäiriö, Panaman murtumavyöhyke. Eteläinen raja on valtameren keskiosien harju, Galapagosin kohouma. Läntinen raja on toinen valtameren keskiosien harju, Itä-Tyynenmeren kohouma.
Galapagossaarten alla oleva kuuma piste sijaitsee Galapagossaarten kohouman varrella. (ks. Galapagossaarten hotspot ja Galapagossaarten mikrolaatta)
Kookoslaatan pohjoispuolella olevan Rivera-laatan uskotaan erkaantuneen Kookoslaatasta 5-10 miljoonaa vuotta sitten. Näiden kahden levyn väliseltä rajalta näyttää puuttuvan selvä muuntautumishäiriö, mutta niitä pidetään silti erillisinä. Erotuttuaan Kookoslaatasta Rivera-laatta alkoi toimia itsenäisenä mikrolaattana.
Vuoden 1985 tuhoisat Meksikon kaupungin maanjäristykset ja vuoden 2017 Chiapasin maanjäristys olivat seurausta Kookoslaatan subduktiosta Pohjois-Amerikan laatan alle. Tammikuun 2001 ja helmikuun 2001 tuhoisat El Salvadorin maanjäristykset syntyivät tämän laatan subduktiosta Karibian laatan alle.