OMIM Entry – * 410000 – AMELOGENIN, Y-CHROMOSOMAL; AMELY

TEKSTI

Tutkiessaan ihmisen Y-kromosomista peräisin olevia DNA-fragmenttiklooneja Nakahori ym. (1991) löysivät kloonin, AMELYn, joka oli erityisen hyvin säilynyt nisäkkäiden evoluutiossa. Homologisia sekvenssejä löytyi myös X-kromosomista (AMELX; 300391). Sekvenssit olivat homologisia aiemmin sekvensoitujen hiiren ja naudan amelogeniinia koodaavien cDNA-kloonien kanssa.

Salido ym. (1992) esittivät todisteita urosten kehittyvien hampaan silmujen tutkimuksista, että sekä AMGX- että AMGY-geeni ovat transkriptiivisesti aktiivisia. Molempien geenien promoottorialue ja ennustetut proteiinisekvenssit esiteltiin. Nämä eivät ole pseudoautosomaalisia geenejä, sillä AMGX-geenin amelogenesis imperfectaa aiheuttavien mutaatioiden suhteen heterotsygootit naaraat osoittavat lyonisaatiota eli mosaiikkimaista kiilteen poikkeavuutta.

Nakahori ym. (1991) tunnistivat 3 eksonia sekä AMELY- että AMELX-geeneissä.

Y-kromosomissa oleva AMELY-geeni vastaa AMELX-geeniä, jonka Lau ym. kartoittivat kromosomille Xp22.3-p22.1 (1989). Lau et al. (1989) osoittivat AMELY-geenin Y-kromosomin perisentriselle alueelle, mahdollisesti Yq11:lle, hybridisoimalla DNA:n ihmisen ja hiiren hybridisoluista, jotka sisälsivät erilaisia X- ja Y-kromosomien deleetioita. Mahdollinen suhde hampaiden kokoa varten postuloituun Y-kromosomilokukseen, joka karttuu suunnilleen samalle alueelle (ks. 475000), on epäselvä.

Hiiren amelogeniinigeeni näyttää sijaitsevan yksinomaan X-kromosomissa (Chapman ym., 1991).

Bailey ym. (1992) saivat deletio-kartoituksella, joka perustui XX-urospuolisilta potilailta (joilla oli X-Y-vaihto) ja henkilöiltä, joilla oli poikkeava Y-kromosomi, saaduista DNA:sta tehtyyn analyysiin, tuloksia, jotka poikkeavat niistä raporteista, jotka kartoittivat AMELY:n proksimaaliseen Yq:hen. Heidän havaintonsa sijainnista Yp:ssä voitaisiin sovittaa yhteen olettamalla, että Y:ssä on perisentrisiä inversiopolymorfismeja yleisessä väestössä. Tämä hypoteesi voitaisiin testata käyttämällä in situ -hybridisaatiota AMELY:n Y-lokalisoitumisen tutkimiseksi suuressa sarjassa normaaleja Y-kromosomeja.

Faerman ym. (1995) kehittivät AMG-geenin amplifiointiin perustuvan herkän ja luotettavan menetelmän sukupuolen tunnistamiseksi arkeologisissa ihmisjäännöksissä. AMGY-alleelissa on pieni deletio ensimmäisessä intronissa, mikä helpottaa erillisten X- ja Y-spesifisten PCR-alkuaineiden suunnittelua. Menetelmällä määritettiin sukupuoli 18 henkilön, myös pienten lasten, luurangon jäänteistä 22:sta tutkitusta yksilöstä, jotka olivat peräisin 200 ja noin 8 000 vuoden takaisilta ajanjaksoilta. Kuori- ja kallonluista sekä hampaista löytyi riittävästi säilynyttä DNA:ta.

Lattanzi ym. (2005) löysivät kahdelta toisiinsa liittymättömältä yksilöltä suuren interstitiaalisen deletion Y:n lyhyestä käsivarresta, joka käsittää AMELY-lokuksen. Toinen tapaus tunnistettiin 493 hedelmättömän miehen otoksesta; toinen oli peräisin tutkimuksista, jotka oli tehty 13 000 valikoimattomasta lapsivesinäytteestä, jotka oli otettu miespuolisista sikiöraskauksista (mikä osoittaa 0,008 %:n kokonaisesiintyvyyttä). Lattanzi ja muut (2005) totesivat, että vaikka amelogeniinideleetion esiintymistiheys on pieni, sukupuolta koskevia päätelmiä ei pitäisi tehdä pelkän amelogeniinin perusteella tilanteissa, joissa on kyse synnytystä edeltävästä diagnoosista, isyystestauksesta tai rikostutkinnasta.

Käyttämällä yhdistelmää, jossa kartoitettiin STS-deleetioita, yhdistettiin binäärimarkkereita ja Y-lyhyitä tandemtoistoja sisältäviä haplotyyppejä sekä arvioitiin TSPY:n (480100) kopiolukuja, Jobling ym. (2007) tunnistivat neljä erilaista luokkaa deletioita, jotka vaikuttavat kromosomi Yp:hen 45 miehellä 12 eri populaatiosta. Yleisin deletio-luokka löytyi 41 Y-kromosomissa (91 %), ja se näytti johtuvan ei-allelisesta homologisesta rekombinaatiosta suuren TSPY-toistomäärän ja yksittäisen telomeerisen TSPY-geenin kopion välillä, joka sijaitsee yli 3 Mb:n etäisyydellä määrityksestä. Tämä deleetio johti AMELY-, TBL1Y- (400033) ja PRKY- (400008) geenien häviämiseen, jotka sijaitsevat yksittäisen TSPY-geenin ja TSPY-toistomäärän välisellä alueella, sekä TSPY-kopioiden määrän vähenemiseen. Harvinaisemmat deletoitumisluokat eivät koskeneet suurta TSPY:n toistojoukkoa, mutta johtivat AMELY:n, TBL1Y:n, PRKY:n ja yksittäisen telomeerisen TSPY-kopion lisäksi telomeerisemman PCDH11Y-geenin (400022) häviämiseen. Deletiolinjojen pysyvyys ja laajeneminen yhdessä fenotyyppisten todisteiden kanssa viittasivat siihen, että näiden geenien puuttumisella ei ole merkittäviä haitallisia vaikutuksia.

PCR-analyysin avulla Bailey ym. (1992) havaitsivat AMELY-alkuaineiden ja PCR-tuotteen koon huomattavan pitkälle säilyneen ihmisapinoiden ja vanhan maailman apinoiden välillä.