Marylandin yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan (University of Maryland School of Medicine) tutkijat julkaisivat yhden kokonaisvaltaisimmista analyyseistä siitä, miten geenit ilmentyvät infektioiden aikana (niin sanottu transkriptomi). Analyyseissä on mukana kolme erilaista Streptococcus pneumoniae -bakteerikantaa, jotka aiheuttavat keuhkokuumetta, aivokalvontulehdusta ja välikorvatulehduksia.
Se sisältää myös analyysejä keuhkoista ja neljästä muusta elimistön elimistöstä eläinmallissa, jossa bakteeri asuu, lisääntyy ja vaikuttaa elimistössä. Tutkimustulokset julkaistiin tänään Proceedings of the National Academy of Sciences -lehdessä.
”Uusi analyysimme tarjoaa arvokasta uutta tietoa eläinten isännän ja taudinaiheuttajan vuorovaikutuksesta pneumokokki-infektioiden aikana”, sanoo tutkimuksen päätutkija Hervé Tettelin, PhD, mikrobiologian ja immunologian professori ja Marylandin yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan genomitiedeinstituutin tutkija. ”Se voisi viime kädessä auttaa tutkijoita kehittämään uusia hoitomuotoja tähän bakteeri-infektioon.”
Pneumokokki-infektion oireita voivat olla kuume, yskä, hengenahdistus, rintakipu, niskan jäykkyys, sekavuus, lisääntynyt valoherkkyys, nivelkipu, vilunväristykset, korvakipu, unettomuus ja ärtyneisyys, kuten Centers for Disease Control and Prevention -virastosta (Centers for Disease Control and Prevention) kerrotaan.”
Kun vuonna 2000 otettiin käyttöön ensimmäinen rokote pneumokokki-infektiota vastaan, infektioiden aiheuttamien kuolemantapausten määrä on vähentynyt. Lisääntyvä antibioottiresistenssi on kuitenkin vaikeuttanut joidenkin näiden infektioiden hoitoa.
Marylandin yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan tutkijat tekivät yhteistyötä Birminghamin Alabaman yliopiston ja Yalen yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan tutkijoiden kanssa analysoidakseen geeniekspressiota eri infektiokohteissa, kuten nenä- ja kurkkukäytävissä, sydämessä, verenkierrossa, keuhkoissa ja munuaisissa.
He loivat atlaksen näistä geeniekspressiotiedoista ja havaitsivat, että bakteeri käyttäytyy eri tavoin riippuen siitä, mihin kohtaan se tarttuu hiirimallissa, ja hiiren elimet puolestaan reagoivat myös eri tavoin.
He havaitsivat myös, että tietyt S. pneumoniae -geenit ilmentyvät aina voimakkaasti kaikissa anatomisissa paikoissa, mikä tekee niistä ihanteellisia kohteita uusille rokotteille tai hoidoille. Eläinhaastekokeessa tutkijat havaitsivat, että interferoni beeta -niminen tulehduskipulääkitys esti bakteereja tunkeutumasta elintärkeisiin elimiin.
Tämä edisti isännän selviytymistä ja antoi meille tärkeää tietoa mahdollisista uusista hoitokeinoista. Pystyimme rakentamaan analyyttisten putkistojen varaan kattavamman tavan tutkia erilaisia systeemisiä patogeenejä.”
Adonis D’Mello, tutkimuksen toinen tekijä ja molekyylilääketieteen jatko-opiskelija, Institute for Genome Sciences
Rahoitus saatiin Merckin tutkijatutkimusohjelmasta (Merck Investigator Studies Program), jolla tuetaan ulkopuolisten tutkijoiden aloitteesta aloitettua, suunniteltua ja toimeenpanemaa, hypoteeseja synnyttävää kliinistä ja prekliinistä tutkimusta. Tätä hanketta tuettiin myös National Institutes of Healthin, National Institute of Allergy and Infectious Diseasesin varoilla.
”Tämä on erittäin jännittävä perustutkimustulos, jolla voi olla laajoja vaikutuksia ymmärrykseemme laajalle levinneestä ja potentiaalisesti vaarallisesta tartuntataudista”, sanoi tohtori E. Albert Reece, MBA, UM Baltimoren lääketieteellisistä asioista vastaava varatoimitusjohtaja sekä John Z. ja Akiko K. Bowersin arvostettu professori ja dekaani Marylandin yliopiston lääketieteellisessä tiedekunnassa.
”Sillä on myös laajempia sovellusmahdollisuuksia transkriptomitutkimuksen alalla mahdollisten uusien sairauksien hoitomuotojen löytämiseksi.”