La maladie d’Alzheimer (MA) est la maladie neurodégénérative la plus répandue dans le monde, mais son étiologie n’est toujours pas complètement comprise. L’identification des mécanismes pathologiques sous-jacents devient de plus en plus importante pour la découverte de biomarqueurs et de thérapies, pour lesquels la métabolomique présente un grand potentiel. Dans ce travail, nous avons étudié les altérations métaboliques dans différentes régions du cerveau des souris APP/PS1 en utilisant une approche métabolomique à haut débit basée sur la combinaison de la chromatographie gazeuse-spectrométrie de masse et de la chromatographie liquide à ultra-haute performance-spectrométrie de masse. Les statistiques multivariées ont montré que les perturbations métabolomiques sont généralisées, affectant principalement l’hippocampe et le cortex, mais sont également présentes dans des régions qui ne sont pas principalement associées à la MA, comme le striatum, le cervelet et les bulbes olfactifs. De multiples voies métaboliques pourraient être liées au développement de troubles de type MA dans ce modèle de souris, notamment un métabolisme anormal des purines, des défaillances bioénergétiques, une dyshoméostasie des acides aminés et des perturbations des lipides membranaires, entre autres. Il est intéressant de noter que des altérations spécifiques à une région ont été observées pour certains des marqueurs potentiels identifiés, associés à une composition anormale des acides gras des phospholipides et des sphingomyélines, ou à une régulation différentielle des acides aminés des neurotransmetteurs (par exemple, glutamate, glycine, sérine, N-acétyl-aspartate), non décrits précédemment à notre connaissance. Par conséquent, ces résultats pourraient apporter un nouvel éclairage sur la pathologie cérébrale de la maladie d’Alzheimer.