CAZy

Cet article concerne la base de données. Pour la communauté aux États-Unis, voir Cazy, Virginie-Occidentale.

CAZy est une base de données des enzymes actives sur les glucides (CAZymes). La base de données contient une classification et des informations associées sur les enzymes impliquées dans la synthèse, le métabolisme et la reconnaissance des glucides complexes, c’est-à-dire les disaccharides, les oligosaccharides, les polysaccharides et les glycoconjugués. La base de données comprend des familles de glycoside hydrolases, de glycosyltransférases, de polysaccharides lyases, de carbohydrate esterases et de modules non catalytiques de liaison aux glucides. La base de données CAZy comprend également une classification des enzymes redox à activité auxiliaire impliquées dans la dégradation de la lignocellulose.

CAZy

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Contenu

Description

base de données des enzymes à activité glucidique

Contact

Centre de recherche

AFMB, Centre national de la recherche scientifique français

Laboratoire

Groupe glycogénomique

Citation primaire

Lombard &al. (2014)

Accès

Site web

http://www.cazy.org/

Outils

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy a été créé en 1999 afin de fournir un accès en ligne et constamment mis à jour à la classification des familles de CAZymes basée sur la séquence protéique, qui a été initialement développée au début des années 1990 pour classer les glycoside hydrolases. Les nouvelles entrées sont ajoutées peu après leur apparition dans les versions quotidiennes de GenBank. L’évolution rapide du séquençage de l’ADN à haut débit a entraîné une croissance exponentielle continue de la base de données CAZy, qui couvre désormais des centaines de milliers de séquences. CAZy continue d’être conservée et développée par le groupe Glycogénomique de l’AFMB, un centre de recherche affilié au Centre national de la recherche scientifique français et à Aix-Marseille Université.

La base de données CAZy est couplée à CAZypedia, qui a été lancée en 2007 comme une encyclopédie des CAZymes pilotée par la communauté de recherche et basée sur un wiki.

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