Les valeurs fondamentales maintenues par la Cooperative Baptist Fellowship commencent par quatre éléments que la CBF considère comme des principes baptistes de foi et de pratique.
- La liberté de l’âme est la capacité de toutes les personnes à entrer en relation directe avec Dieu. La croyance dans le sacerdoce de tous les croyants est une base importante de ce principe.
- La liberté biblique est le principe de la reconnaissance de l’autorité de l’Écriture et du droit de chaque chrétien à l’interpréter comme le Saint-Esprit le dirige.
- La liberté de l’Église est l’idée que chaque Église locale est autonome et habilitée à choisir ses propres dirigeants et à diriger ses propres affaires.
- La liberté religieuse est le principe de la séparation de l’Église et de l’État. La FBC soutient ce principe par son affiliation au Comité mixte baptiste pour la liberté religieuse.
La FBC affirme que la Bible enseigne qu’il y a un seul vrai Dieu qui a créé tous les hommes. A cause du péché, l’humanité est séparée de Dieu mais peut être sauvée et rachetée par Jésus-Christ. Le Saint-Esprit convainc et convertit ceux qui croient en Christ et donne à l’Église le pouvoir de remplir sa mission. Les membres de la FBC conviennent que chaque chrétien et chaque église est appelé à accomplir la Grande Commission, à partager l’Évangile de Jésus-Christ et à répondre aux besoins spirituels, physiques et sociaux des personnes et des communautés.
L’affirmation des femmes dans le ministère est l’un des principes fondateurs de la communauté. La plupart des membres de la FBC conviennent que les hommes et les femmes peuvent être ordonnés ministres ou diacres et servir comme pasteurs d’églises. Sur les questions sociales, la FBC n’émet pas de prises de position. Les membres de la FBC s’accordent à dire qu’étant donné qu’il s’agit d’une communauté d’églises autonomes, la publication de déclarations irait au-delà de son objectif. Toutefois, elle dispose d’une politique organisationnelle sur les comportements homosexuels. Toutefois, les politiques de la FBC ne sont pas contraignantes pour les congrégations individuelles qui prennent leurs propres décisions sur toute question ; une congrégation ne peut pas non plus être exclue de la FBC parce qu’elle n’est pas d’accord avec les valeurs ou les politiques fondamentales. Par exemple, la Calvary Baptist Church de Lexington, KY, une congrégation membre importante de la FBC, autorise les homosexuels à occuper des postes de direction, y compris celui de diacre, et la Calvary Baptist Church de DC, une autre congrégation membre, célèbre des mariages entre personnes du même sexe. En outre, la FBC a coparrainé une conférence sur la sexualité et a lancé le « ‘Projet d’illumination’ approuvé par le Conseil d’administration (anciennement le Conseil de coordination) pour développer des modèles permettant à la communauté de la FBC d’exprimer ses différences non seulement sur l’interdiction d’embauche mais aussi sur d’autres questions brûlantes qui divisent les églises, les dénominations et la société ».