A vonatkozó biológia bemutatásával kezdünk, elmagyarázva, hogy mit és miért mérünk. Ezután a két fő mérési technológiára összpontosítunk: az újgenerációs szekvenálásra és a microarraykra. Ezután rátérünk annak leírására, hogyan importáljuk a nyers adatokat és a kísérleti információkat az R-be, és hogyan használjuk a Bioconductor osztályokat ezen adatok rendszerezésére, akár helyben generáltuk őket, akár nyilvános adattárakból vagy intézményi archívumokból szedtük le őket. A genomi jellemzőket általában a genomi koordináták intervallumainak segítségével azonosítjuk, és részletesen megvizsgáljuk a genomi intervallumokkal való számítás rendkívül hatékony algoritmusait. A génközpontú vagy útvonal-központú hipotézisek tesztelésére szolgáló statisztikai módszerek genomszintű adatokkal olyan csomagokban találhatók, mint a limma, e technikák közül néhányat az előadásokon és a laborokban illusztrálunk.
A hallgatóink eltérő képzettségére való tekintettel a sorozatot hét részre osztottuk. A teljes sorozatot vagy az Önt érdeklő egyes kurzusokat is felveheti. Ha statisztikusok vagytok, fontoljátok meg, hogy az első két-három kurzust kihagyjátok, hasonlóképpen, ha biológusok vagytok, fontoljátok meg, hogy a bevezető biológia előadások egy részét kihagyjátok. Vegye figyelembe, hogy az első három kurzus során a statisztika és a programozás nehézsége viszonylag gyorsan növekszik. A harmadik kurzuson már haladó statisztikai fogalmakat, például hierarchikus modelleket, a negyedik kurzuson pedig haladó szoftverfejlesztési ismereteket, például párhuzamos számítási és reprodukálható kutatási koncepciókat tanítunk.
Ezek a kurzusok két szakmai tanúsítványt alkotnak, és önköltséges tanfolyamok:
Adatelemzés az élettudományok számára:
- PH525.1x: Statisztika és R az élettudományok számára
- PH525.2x: Bevezetés a lineáris modellekbe és a mátrixalgebrába
- PH525.3x: Statisztikai következtetés és modellezés nagy áteresztőképességű kísérletekhez
- PH525.4x: Nagydimenziós adatelemzés
Genomikai adatelemzés:
- PH525.5x: Bevezetés a Bioconductorba
- PH525.6x: Esettanulmányok a funkcionális genomikában
- PH525.7x: Advanced Bioconductor
Ezt az órát részben az NIH R25GM114818 támogatásával támogatták.
A HarvardX megköveteli, hogy azok a személyek, akik beiratkoznak a kurzusaira az edX-en, betartsák az edX becsületkódex feltételeit. Az edX becsületkódex megsértése esetén a HarvardX megfelelő korrekciós intézkedéseket tesz, amelyek magukban foglalhatják a HarvardX-tanfolyamról való elbocsátást; a HarvardX-tanfolyamra kapott tanúsítványok visszavonását; vagy a körülményeknek megfelelően más jogorvoslati lehetőségeket. Az ilyen jogsértések miatti korrekciós intézkedések esetén nem kerül sor visszatérítésre. Azokra a beiratkozott hallgatókra, akik a HarvardX kurzusait egy másik program részeként veszik fel, szintén az adott program tanulmányi szabályzata vonatkozik.
A HarvardX a tanulás tudományát követi. Azzal, hogy online tanulóként regisztrál egy HX kurzusra, a tanulással kapcsolatos kutatásban is részt vesz. Olvassa el kutatási nyilatkozatunkat, ha többet szeretne megtudni.
A Harvard Egyetem és a HarvardX elkötelezett a biztonságos és egészséges oktatási és munkakörnyezet fenntartása mellett, amelyben a közösség egyetlen tagját sem zárják ki a programunkban való részvételből, nem tagadják meg tőle az előnyöket, illetve nem teszik ki diszkriminációnak vagy zaklatásnak. A HarvardX közösség minden tagjától elvárjuk, hogy tartsa be a Harvard megkülönböztetésmentességre vonatkozó irányelveit, beleértve a szexuális zaklatást is, valamint az edX szolgáltatási feltételeit. Ha bármilyen kérdése vagy aggálya van, kérjük, forduljon a [email protected] címre és/vagy jelezze tapasztalatait az edX kapcsolatfelvételi űrlapján keresztül.