| Citrát (Si)-szintáz | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | ||||||
| EC no. | 2.3.3.1 | |||||
| CAS no. | 9027-96-7 | |||||
| Adatbázisok | ||||||
| IntEnz | IntEnz nézet | |||||
| BRENDA | BRENDA bejegyzés | |||||
| ExPASy | NiceZyme nézet | |||||
| KEGG | KEGG bejegyzés | |||||
| MetaCyc | metabolikus útvonal | |||||
| PRIAM | profil | |||||
| PDB struktúrák | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||
| Gene Ontology | AmiGO / QuickGO | |||||
| Search | PMC | PubMed | NCBI | |||
MechanismEdit
A citrát-szintáz aktív helyén (az úgynevezett katalitikus triádban) három kulcsfontosságú aminosav található, amelyek katalizálják az acetil-CoA és oxaloacetát citráttá és H-SCoA-vá alakítják egy aldol-kondenzációs reakcióban. Ez az átalakulás úgy kezdődik, hogy az Asp-375 negatív töltésű karboxilát oldallánc oxigénatomja deprotonálja az acetil-CoA alfa-szénatomját, hogy egy enolát-aniont képezzen, amelyet viszont a His-274 protonálása semlegesít, így egy enol intermedier keletkezik. Ezen a ponton a His-274-en az utolsó lépésben képződött epsilon nitrogén magányos elektronpárja elvonja a hidroxil enol-protont, hogy egy enolát-aniont képezzen, amely nukleofil támadást indít az oxalacetát karbonil-szénatomján, ami viszont deprotonálja a His-320 epsilon nitrogénatomját. Ez a nukleofil addíció citroil-CoA képződését eredményezi. Ezen a ponton egy vízmolekula deprotonálódik a His-320 epsilon nitrogénatomjánál, és megindul a hidrolízis. Az oxigén egyik magányos párja nukleofil módon megtámadja a citroil-CoA karbonil szénjét. Ez egy tetraéderes köztiterméket képez, és a -SCoA kilökődését eredményezi a karbonil reformjaként. A -SCoA protonálódik, így HSCoA keletkezik. Végül az előző lépésben a karbonilhoz hozzáadott hidroxil deprotonálódik, és citrát keletkezik.
GátlásSzerkesztés
Az enzimet gátolja a magas ATP:ADP és NADH:NAD arány, mivel a magas ATP és NADH koncentráció azt mutatja, hogy a sejt energiaellátása magas. Gátolja továbbá a szukcinil-CoA és a propionil-CoA, amely hasonlít az acetil-CoA-ra, és kompetitív inhibitorként hat az acetil-CoA-ra és nem kompetitív inhibitorként az oxalacetátra. A citrát gátolja a reakciót, és példa a termékgátlásra. a citrát-szintáz acetil-CoA-analógok általi gátlását szintén jól dokumentálták, és arra használták, hogy bizonyítsák az egyetlen aktív centrum létezését. Ezek a kísérletek kimutatták, hogy ez az egyetlen hely két forma között váltakozik, amelyek a ligáz-, illetve a hidroláz-aktivitásban vesznek részt. Ez a fehérje az allosztérikus szabályozás morfium-modelljét használhatja.