Kambodzsa zászlaján 1850 körül óta Angkor Wat ábrázolása látható középen. A jelenlegi zászló, a kék bonce 1948-ban. 1970. október 9-ig használták, amikor új zászlót vezettek be Lon Nol khmer köztársasága számára, amely a vörös khmerek 1975-ös hatalomátvételéig tartott. Az ezt követő, 1975 és 1979 között létező Demokratikus Kampuchea állam 1976-tól kezdve vörös zászlót használt a sárga színű, háromtornyú Angkor Wat mintájával. A Kambodzsa elleni vietnami inváziót követően 1979-ben jött létre a Kampucheai Népköztársaság.
A Kampucheai Nemzeti Egyesült Nemzeti Megmentési Front (FUNSK) újjáélesztette az új állam számára az Issarak khmerek által a franciaellenes ellenállás napjaiban elfogadott zászlót. Ez a zászló ugyanazzal a színmintával rendelkezett, mint a DK zászlója, de egy sárga, öttornyú Angkor Wat sziluettel. Amikor a PRK 1989-ben átnevezte magát “Kambodzsai Állam”-ra (SOC), a zászló alsó fele kék lett. Az UNTAC zászlaját az 1992-1993-as átmeneti időszakban az SOC zászlajával együtt használták Kambodzsán belül.
1993-ban újra elfogadták az 1948-as kambodzsai zászlót. A jelenlegi kambodzsai zászló Afganisztán, Bolívia, Portugália, San Marino és Spanyolország zászlajával együtt az egyetlen hat olyan állami zászló, amelyen egy épület látható. A vörös és a kék Kambodzsa hagyományos színei.
A ma használt zászló ugyanaz, mint az 1948-ban létrehozott, bár a régebbi zászlóról néha azt mondják, hogy vörös körvonallal ábrázolta Angkor Watot, míg a jelenlegi zászló kifejezetten feketét használ. Azóta öt másik közbeeső tervet használtak. Szinte mindegyik az Angkor Wat templom képét használta valamilyen formában. Ezt a híres templomhelyet, amely a 12. századból származik, a Mahidharapura uralkodók építették. Öt tornya van, de ezeket nem mindig a zászlókon használt stilizált változatban ábrázolták. A monarchiát 1993 szeptemberében állították vissza, az 1948-as zászlót ugyanezen év júniusában vették újra használatba.