A kromoplasztokat nem tanulmányozzák széles körben, és ritkán állnak a tudományos kutatások középpontjában. Gyakran játszanak szerepet a paradicsomnövény (Solanum lycopersicum) kutatásában. A termesztett paradicsomban az érett gyümölcs piros színéért a likopin felelős, míg a virágok sárga színét a violaxantin és a neoxantin nevű xantofillok adják.
A karotinoidok bioszintézise a kromoplasztokban és a kloroplasztokban egyaránt zajlik. A paradicsomvirágok kromoplasztjaiban a karotinoidszintézist a Psyl, Pds, Lcy-b és Cyc-b gének szabályozzák. Ezek a gének, mások mellett, felelősek a karotinoidok képződéséért a szervekben és struktúrákban. Az Lcy-e gén például nagymértékben expresszálódik a levelekben, ami a karotinoid lutein termelését eredményezi.
A fehér virágokat egy recesszív allél okozza a paradicsomnövényekben. A termesztett növényekben kevésbé kívánatosak, mert alacsonyabb a beporzási arányuk. Egy tanulmányban azt találták, hogy a fehér virágokban még mindig jelen vannak a kromoplasztiszok. A sárga pigment hiánya a szirmaikban és a porzóikban a CrtR-b2 gén mutációjának köszönhető, amely megszakítja a karotinoid-bioszintézis útját.
A kromoplasztok kialakulásának teljes folyamata molekuláris szinten még nem teljesen ismert. Az elektronmikroszkópia azonban feltárta a kloroplasztból kromoplasztba történő átalakulás egy részét. Az átalakulás a belső membránrendszer átalakításával kezdődik, az intergránális tilakoidok és a grana lízisével. Új membránrendszerek alakulnak ki szervezett membránkomplexumokban, az úgynevezett tilakoid plexusokban. Az új membránokban karotinoidkristályok képződnek. Ezek az újonnan szintetizált membránok nem a tilakoidokból, hanem a plasztid belső membránjából keletkező vezikulákból származnak. A legnyilvánvalóbb biokémiai változás a fotoszintetikus génexpresszió leszabályozása lenne, ami a klorofill elvesztését és a fotoszintetikus aktivitás leállítását eredményezi.
A narancsban a karotinoidok szintézise és a klorofill eltűnése miatt a gyümölcs színe zöldről sárgára változik. A narancssárga színt gyakran mesterségesen adják hozzá – a világossárga-narancs a tényleges kromoplasztiszok által létrehozott természetes szín.
A Valencia narancs Citris sinensis L a Florida államban nagy mennyiségben termesztett, termesztett narancs. A Valencia-narancs télen éri el optimális narancssárga héjszínét, míg tavasszal és nyáron zöld színűvé válik. Míg eredetileg úgy gondolták, hogy a kromoplasztiszok a plasztidok fejlődésének végső stádiuma, 1966-ban bebizonyosodott, hogy a kromoplasztiszok vissza tudnak alakulni kloroplasztiszokká, ami miatt a narancsok újra zölddé válnak.