CAZy

Dit artikel gaat over de databank. Voor de gemeente in de Verenigde Staten, zie Cazy, West Virginia.

CAZy is een database van koolhydraat-actieve enzymen (CAZymes). De database bevat een classificatie en bijbehorende informatie over enzymen die betrokken zijn bij de synthese, het metabolisme en de herkenning van complexe koolhydraten, d.w.z. disachariden, oligosachariden, polysachariden, en glycoconjugaten. In de database zijn families opgenomen van glycosidehydrolasen, glycosyltransferasen, polysaccharidelyasen, koolhydraatesterasen en niet-katalytische koolhydraatbindende modules. De CAZy-database bevat ook een classificatie van redox-enzymen met hulpactiviteit die betrokken zijn bij de afbraak van lignocellulose.

CAZy

Database.png

Inhoud

Beschrijving

databank van koolhydraat-actieve enzymen

Contact

Onderzoekscentrum

AFMB, Frans Nationaal Centrum voor Wetenschappelijk Onderzoek

Laboratorium

Glycogenomics groep

Primaire citatie

Lombard & al. (2014)

Toegang

Website

http://www.cazy.org/

Tools

Web

http://research.ahv.dk/cazy

http://mothra.ornl.gov/cgi-bin/cat/cat.cgi

http://csbl.bmb.uga.edu/dbCAN/

CAZy is in 1999 opgericht om online en voortdurend bijgewerkte toegang te bieden tot de op eiwitsequenties gebaseerde familieclassificatie van CAZymen, die oorspronkelijk in het begin van de jaren negentig is ontwikkeld om de glycosidehydrolasen te classificeren. Nieuwe gegevens worden toegevoegd kort nadat zij in de dagelijkse versies van GenBank zijn verschenen. De snelle evolutie van high-throughput DNA sequenering heeft geresulteerd in een voortdurende exponentiële groei van de CAZy databank, die nu honderdduizenden sequenties bevat. CAZy wordt nog steeds gecureerd en ontwikkeld door de Glycogenomics groep van AFMB, een onderzoekscentrum gelieerd aan het Franse Nationale Centrum voor Wetenschappelijk Onderzoek en de Aix-Marseille Universiteit.

De CAZy database is gekoppeld aan CAZypedia, die in 2007 werd gelanceerd als een door de onderzoeksgemeenschap gestuurde, wiki-gebaseerde encyclopedie van CAZymen.

Plaats een reactie