Het centimorgan (afgekort cM, genoemd naar Thomas Hunt Morgan) is een hulpmaateenheid in de genetica die de frequentie of waarschijnlijkheid van recombinatie in procenten aangeeft. Op deze manier kan de genetische afstand worden gekwantificeerd, d.w.z. de genetische afstand tussen twee loci op een chromosoom.
Genenen die zich op hetzelfde chromosoom bevinden, kunnen worden “losgekoppeld” door kruising. Het verwachte aantal van deze cross-over gebeurtenissen kan worden geschat uit de (waargenomen) recombinatiefrequentie.
Twee loci liggen 1 cM uit elkaar als de recombinatie (d.w.z. crossing over) waarschijnlijkheid tussen deze loci is 1% per meiose, d.w.z. dat er gemiddeld één crossing over optreedt in 100 meiose:
R e c o m b i n a t i e = 100 ⋅ D e r e c o m b i n a t i e {\displaystyle \mathrm {recombinatie,} =100\cdot {\frac {\mathrm {aantal;van;recombinant;gameten} }{\mathrm {gameten;totaal}} 
(voor de vorming van een zygote heeft men twee gameten nodig, bij de vorming waarvan telkens recombinatie kan hebben plaatsgevonden).