In 2003 hebben beleggers in Lancer Group Citco voor de rechter gedaagd omdat het bedrijf willens en wetens “misleidende” verklaringen over de intrinsieke waarde (net asset value, NAV) zou hebben verspreid. Citco deelde beleggers uiteindelijk mee dat het zijn functie als beheerder van de fondsen van Lancer neerlegde, maar gaf geen verklaring. Citco wees erop dat zij de raad van bestuur van Lancer om verklaringen had gevraagd over de juistheid van de waarderingen, maar rechter Shira Scheindlin schreef: “Hoewel deze acties aantonen dat Citco Group vraagtekens zette bij de cijfers, kunnen ze ook worden geïnterpreteerd als pogingen van Citco Group om haar eigen betrokkenheid bij het proces af te schermen”. Uiteindelijk schikte Citco met beleggers.
In 2013 klaagden drie Louisiana-pensioensystemen die $ 100 miljoen hadden geïnvesteerd in een hedgefonds dat hoge rendementen beloofde met een laag risico Citco aan, dat de deal beheerde. De aanklacht beweerde dat Citco pensioenbeheerders vertelde dat hun investering aan waarde won terwijl dat niet waar was, omdat Citco de beleggers misleidde over de werkelijke waarde van de activa van de investering.
In maart 2015 dienden Roger Corman en zijn vrouw een rechtszaak in tegen Citco waarin ze oorzaken aanvoerden waaronder schending van fiduciaire plicht, fraude, onjuiste voorstelling van zaken en ongerechtvaardigde verrijking, zeggende dat ze uiteindelijk tot $ 60 miljoen verloren als gevolg van de ongepaste acties en inacties van Citco, de beheerder van het fonds.
Beleggers in Fairfield Greenwich Group, de grootste exploitant van “feeder funds” voor Ponzi schemer Bernard Madoff, spanden een rechtszaak aan tegen Citco in de zaak Anwar v. Fairfield Greenwich, U.S. District Court, Southern District of New York, voor rechter Shira Scheindlin. De beleggers stelden dat Citco verplicht was om onafhankelijk de NAV’s van de fondsen te berekenen en deze cijfers aan de aandeelhouders te verstrekken, maar in plaats daarvan: “Citco heeft blindelings en roekeloos vertrouwd op door Madoff en de fondsen verstrekte informatie om de intrinsieke waarde van de fondsen te berekenen en te verspreiden … ook al was die informatie duidelijk foutief.” Citco werd ervan beschuldigd de beleggingen van Fairfield Greenwich, waarvan meer dan $ 7 miljard naar Bernard L. Madoff Investment Securities LLC werden gestuurd, niet naar behoren te controleren en te waarderen. De beleggers zeiden dat ze grote verliezen leden door het bedrog en de nalatigheid van Citco zodra Madoff’s Ponzi-regeling in december 2008 aan het licht kwam. In augustus 2015 stemde Citco ermee in om $ 125 miljoen te betalen om claims te schikken dat het beleggers misleidde om te investeren met Fairfield Greenwich Group. De schikking was de grootste met een beheerder of bewaarder in verband met Madoff’s fraude.