We beginnen met een inleiding tot de relevante biologie, waarbij we uitleggen wat we meten en waarom. Daarna richten we ons op de twee belangrijkste meettechnologieën: next generation sequencing en microarrays. Daarna beschrijven we hoe ruwe data en experimentele informatie in R worden geïmporteerd en hoe we Bioconductor klassen gebruiken om deze data te organiseren, of ze nu lokaal zijn gegenereerd, of afkomstig zijn uit publieke repositories of institutionele archieven. Genomische kenmerken worden over het algemeen geïdentificeerd met behulp van intervallen in genomische coördinaten, en zeer efficiënte algoritmen voor het rekenen met genomische intervallen zullen in detail worden onderzocht. Statistische methoden voor het testen van gen-centrische of pathway-centrische hypotheses met genoom-schaal gegevens zijn te vinden in pakketten zoals limma, een aantal van deze technieken zal worden geïllustreerd in lezingen en labs.
Gezien de diversiteit in educatieve achtergrond van onze studenten hebben we de serie in zeven delen verdeeld. Je kunt de hele serie volgen of afzonderlijke cursussen die je interesseren. Als u een statisticus bent, kunt u overwegen de eerste twee of drie cursussen over te slaan, en als u een bioloog bent, kunt u overwegen enkele van de inleidende biologielessen over te slaan. Merk op dat de statistiek- en programmeeraspecten van de cursus relatief snel in moeilijkheidsgraad toenemen in de eerste drie cursussen. In de derde cursus leert u geavanceerde statistische concepten, zoals hiërarchische modellen, en in de vierde geavanceerde software-engineeringvaardigheden, zoals parallel computing en reproduceerbare onderzoeksconcepten.
Deze cursussen vormen twee Professional Certificates en zijn op eigen tempo te volgen:
Data Analysis for Life Sciences:
- PH525.1x: Statistiek en R voor de biowetenschappen
- PH525.2x: Inleiding tot lineaire modellen en matrixalgebra
- PH525.3x: Statistical Inference and Modeling for High-throughput Experiments
- PH525.4x: Hoog-dimensionale data-analyse
Genomics Data Analysis:
- PH525.5x: Inleiding tot Bioconductor
- PH525.6x: Case Studies in Functionele Genomica
- PH525.7x: Advanced Bioconductor
Deze cursus werd gedeeltelijk ondersteund door NIH grant R25GM114818.
HarvardX eist van personen die zich inschrijven voor zijn cursussen op edX dat zij zich houden aan de voorwaarden van de edX honor code. HarvardX zal passende corrigerende maatregelen nemen bij overtredingen van de edX erecode, waaronder mogelijk ontslag van de HarvardX-cursus, intrekking van certificaten die voor de HarvardX-cursus zijn ontvangen, of andere maatregelen indien de omstandigheden dit rechtvaardigen. Er wordt geen geld teruggegeven in het geval van corrigerende maatregelen voor dergelijke overtredingen. Deelnemers die HarvardX cursussen volgen als onderdeel van een ander programma vallen ook onder het academisch beleid van die programma’s.
HarvardX streeft de wetenschap van het leren na. Door u als online cursist in te schrijven voor een HX-cursus, neemt u ook deel aan onderzoek over leren. Lees onze onderzoeksverklaring voor meer informatie.
Harvard University en HarvardX zijn toegewijd aan het handhaven van een veilige en gezonde onderwijs- en werkomgeving waarin geen lid van de gemeenschap wordt uitgesloten van deelname aan, de voordelen worden ontzegd van, of wordt onderworpen aan discriminatie of intimidatie in ons programma. Alle leden van de HarvardX-gemeenschap worden geacht zich te houden aan het Harvard-beleid voor non-discriminatie, waaronder seksuele intimidatie, en de edX Terms of Service. Als u vragen of zorgen heeft, neem dan contact op met [email protected] en/of meld uw ervaring via het edX contactformulier.