6.3: Auksotrofy i podłoża selektywne

Mutanty Met są auksotrofami Met, co oznacza, że nie są w stanie rosnąć w podłożach, które nie zawierają Met. Auxotrofy są mikroorganizmami, które nie są w stanie syntetyzować istotnego składnika odżywczego z powodu mutacji genu. Wiele szczepów laboratoryjnych posiada wiele mutacji, które zakłócają syntezę niezbędnych składników odżywczych. Na przykład, ponieważ szczep BY4742 posiada mutacje w genach HIS3, LEU2, LYS2 i URA3, szczep ten będzie rósł tylko w podłożach zawierających histydynę, leucynę, lizynę i uracyl. Szczepy auksotroficzne mają wiele zastosowań w genetyce. Naukowcy często używają szczepów auksotroficznych jako gospodarzy do transformacji plazmidów (Rozdział 12). Plazmidy używane do transformacji niosą funkcjonalne allele genu, który jest wadliwy w szczepie gospodarza, co umożliwia selekcję transformantów na podstawie ich zdolności do wzrostu na podłożu pozbawionym niezbędnego składnika odżywczego.

Podłoża syntetyczne są podstawowym narzędziem do hodowli i badania auksotrofów, ponieważ wszystkie ich składniki są zdefiniowane. Naukowcy zajmujący się drożdżami opracowali wiele różnych formuł podłoży syntetycznych. Wszystkie pożywki syntetyczne zawierają źródło węgla (zwykle D-glukozę), źródło azotu oraz niezbędne witaminy i minerały. Witaminy i minerały są zazwyczaj kupowane
w formie znanej jako drożdżowa baza azotowa (YNB). Suplementy dodawane do pożywek syntetycznych mogą być dostosowane tak, aby wspierać lub selekcjonować wzrost poszczególnych genotypów. W tym kursie będziemy używać pożywki Yeast Complete (YC), która wspiera wzrost większości szczepów S. cerevisiaestrains. Tempo wzrostu szczepów typu dzikiego w YC jest nieco wolniejsze niż w podłożach bogatych, takich jak YPD, ale szczepy są zdolne do życia przez długi czas. Tabela na następnej stronie pokazuje skład YC, który zawiera bogate zaopatrzenie w aminokwasy i zasady nukleotydowe. Oprócz kompletnej pożywki YC, będziemy również używać pożywek selektywnych, w których niektóre składniki zostały pominięte. Na przykład, w tym laboratorium użyjemy pożywki YC-Met „drop-out”, która zawiera wszystkie składniki YC z poniższej tabeli, z wyjątkiem metioniny.

.

Dodaj komentarz