Cardinal Mooney została założona w 1956 roku i jest prowadzona przez rzymskokatolicką diecezję Youngstown. Na początku lat 50-tych, diecezja Youngstown uznała potrzebę rozszerzenia Ursuline High School i zbudowania nowej parafialnej szkoły średniej na południowej stronie. W 1953 roku, biskup Emmet M. Walsh uzyskał obecną lokalizację Liceum Kardynała Mooneya od Wydziału Parków Youngstown i rozpoczął organizację komitetu zbierania funduszy na szkołę średnią.
Podłoże zostało przerwane w 1954 roku, a jesienią 1955 roku pierwsza klasa została zorganizowana i zaczęła uczęszczać na zajęcia w starym klasztorze Glenmary. Budowa Cardinal Mooney została zakończona na czas przed pierwszym dniem szkoły we wrześniu 1956 roku. W sumie 610 uczniów zostało zapisanych jako pierwszoklasiści lub drugoklasiści. Szkoła została nazwana na cześć kardynała Edwarda Mooneya, byłego mieszkańca południowej części miasta, który był arcybiskupem Detroit. Wyróżnił się jako uczony i dyplomata Watykanu.
Ojciec William Anthony Hughes, późniejszy biskup Covington, Kentucky, został nazwany pierwszym dyrektorem szkoły. Jako kolory szkoły wybrano czerwień i złoto. Symbolizowały one krew męczenników i odpowiedzialność wszystkich chrześcijan za przyjęcie cierpienia i Najświętszego Sakramentu.
W początkowym składzie szkoły były siostry ze wspólnot Urszulanek, Dominikanek, Notre Dame i Wincentianek, dwóch księży i pięciu świeckich nauczycieli.
W czerwcu 1959 roku pierwsza klasa kończąca szkołę odprawiła mszę świętą bakalaureatową w katedrze św. Kolumby, a 7 czerwca uroczystości ukończenia szkoły odbyły się w Stambaugh Auditorium.
Zapisy rosły szybko na początku lat 60-tych. Do 1960 roku planowano dobudowę do budynku Cardinal Mooney, a nadmiar studentów ponownie uczęszczał na zajęcia w starym klasztorze Glenmary. Dodatek został otwarty w 1961 roku. Zawierał on audytorium, siedem sal lekcyjnych i laboratorium fizyczne.
Na początku 2000 roku, Kardynał Mooney wszedł w posiadanie dwóch budynków wojskowych przylegających do terenu szkoły. Wkrótce po uzyskaniu tej nieruchomości, rozpoczęła się budowa nowego kompleksu sportowego liceum. Ukończony pod koniec 2001 roku, kompleks sportowy Cardinal Mooney jest dobrze zaokrąglonym obiektem treningów lekkoatletycznych, w którym mogą odbywać się oficjalne zawody lekkoatletyczne OHSAA. Kompleks obejmuje boisko do piłki nożnej, dwa przylegające do niego boiska treningowe, dwa korty tenisowe, putting green, boisko do piłki nożnej, dwa boiska do baseballu, małą klatkę, basen treningowy oraz pełnowymiarowy, gumowany tor okalający główne boisko do piłki nożnej. Budynki armii amerykańskiej i marynarki wojennej pozostały na miejscu podczas budowy, ale Rush Boulevard został zasypany ziemią i odcięty od tylnej działki. Budynki, obecnie określane jako Cardinal Mooney Industrial Arts Center, zostały od tego czasu przekształcone w garaże, w których klasy sklepowe mogą pracować nad pojazdami, a klasy jazdy mogą być nauczane podczas przerw letnich.
2013 relocationEdit
W dniu 3 września 2013 roku biskup rzymskokatolickiej diecezji Youngstown, George Murry, zatwierdził przeniesienie szkoły średniej z południowej strony Youngstown na przedmieścia Mahoning County. Jednak jego zgoda spotkała się z zastrzeżeniami, które obejmowały dowód wystarczającego wsparcia finansowego zarówno dla nowego budynku szkoły średniej, jak i funduszu wieczystego w celu zapewnienia stypendiów dla uczniów, którzy zmagają się z ubóstwem i innymi ograniczeniami społecznymi.
Badanie wydane w kwietniu 2013 roku (przeprowadzone przez Catholic School Management, Inc. w Madison, Connecticut) ustaliło, że szkoła utrzymałaby lepszy zapis i przez dłuższy okres czasu, gdyby się przeniosła.
Biskup Murry początkowo sprzeciwiał się przeniesieniu, stwierdzając, że dużym czynnikiem w tej decyzji było to, że taniej byłoby dokonać renowacji niż budować nowy budynek. Ponadto, powiedział w swoim oświadczeniu, ważne jest dla diecezji, aby być dobrym zarządcą swoich finansów. Diecezjalny kurator szkół katolickich powtórzył pierwotne stanowisko Murry’ego i uznał plany, które mogą być wprowadzone w życie dla przyszłości szkoły w jej obecnej lokalizacji. Temat ten wzbudzał kontrowersje wśród rodziców i absolwentów od czasu rozpoczęcia dyskusji na temat przeniesienia w 2013 roku.
W roku szkolnym 2015 rozpoczęły się remonty w obecnej lokalizacji, przez co przeniesienie stało się mało prawdopodobne. Szkoła znajduje się w obecnym miejscu przy ulicy Erie od 1956 roku.
.