Kluczowe wartości utrzymywane przez Cooperative Baptist Fellowship zaczynają się od czterech pozycji, które CBF uważa za baptystyczne zasady wiary i praktyki.
- Wolność duszy jest zdolnością wszystkich ludzi do bezpośredniej relacji z Bogiem. Wiara w kapłaństwo wszystkich wierzących stanowi ważną podstawę tej zasady.
- Wolność Biblii to zasada uznawania autorytetu Pisma Świętego i prawa każdego chrześcijanina do interpretowania go tak, jak kieruje nim Duch Święty.
- Wolność Kościoła to idea, że każdy kościół lokalny jest autonomiczny i uprawniony do wybierania własnych przywódców i kierowania własnymi sprawami.
- Wolność religijna to zasada rozdziału kościoła od państwa. CBF wspiera tę zasadę poprzez przynależność do Wspólnego Komitetu Baptystów ds. Wolności Religijnej.
CBF potwierdza, że Biblia naucza, iż istnieje jeden prawdziwy Bóg, który stworzył wszystkich ludzi. Z powodu grzechu ludzkość jest oddzielona od Boga, ale może być zbawiona i odkupiona przez Jezusa Chrystusa. Duch Święty przekonuje i nawraca tych, którzy wierzą w Chrystusa oraz uzdalnia Kościół do wypełniania jego misji. Członkowie CBF zgadzają się, że każdy chrześcijanin i każdy kościół jest powołany do wypełniania Wielkiego Nakazu, dzielenia się ewangelią Jezusa Chrystusa i służenia duchowym, fizycznym i społecznym potrzebom ludzi i społeczności.
Uznanie kobiet w służbie było jedną z zasad założycielskich Bractwa. Większość członków CBF zgadza się, że zarówno mężczyźni jak i kobiety mogą być wyświęcani na ministrów lub diakonów i służyć jako pastorzy kościołów. W kwestiach społecznych CBF nie wydaje oświadczeń o zajmowanym stanowisku. Członkowie CBF zgadzają się, że ponieważ jest to wspólnota autonomicznych kościołów, wydawanie oświadczeń wykraczałoby poza jej cel. Jednakże, CBF posiada politykę organizacyjną dotyczącą zachowań homoseksualnych. Polityka CBF nie jest jednak wiążąca dla poszczególnych kongregacji, które podejmują własne decyzje w każdej kwestii; nie można również wykluczyć kongregacji z CBF z powodu niezgadzania się z podstawowymi wartościami lub polityką. Na przykład, Calvary Baptist Church w Lexington, KY, wiodąca kongregacja członkowska CBF zezwala homoseksualistom na pełnienie funkcji kierowniczych, w tym diakona kościoła, a Calvary Baptist Church w DC, inna kongregacja członkowska, udziela ślubów osobom tej samej płci. Ponadto CBF współsponsorował konferencję na temat seksualności i zainicjował „Projekt Iluminacja” zatwierdzony przez Radę Zarządzającą (dawniej Radę Koordynacyjną) w celu opracowania modeli dla społeczności Fellowship, które pozwolą na wymianę poglądów nie tylko na temat zakazu zatrudniania, ale również na temat innych palących kwestii dzielących kościoły, denominacje i społeczeństwo”.