Kladogeneza to ewolucyjny podział gatunku macierzystego na dwa odrębne gatunki, tworzące klad.
Zdarzenie to ma miejsce zwykle wtedy, gdy kilka organizmów trafia na nowe, często odległe obszary lub gdy zmiany środowiskowe powodują kilka wymierań, otwierając nisze ekologiczne dla ocalałych i powodując wąskie gardła populacji oraz efekty założyciela zmieniające częstości alleli w dywergencyjnych populacjach w stosunku do ich populacji przodków. Wydarzenia, które powodują, że te gatunki pierwotnie oddzielają się od siebie na odległych obszarach, mogą nadal pozwalać obu gatunkom mieć równe szanse na przetrwanie, rozmnażanie, a nawet ewolucję w celu lepszego dopasowania się do środowiska, podczas gdy nadal są to dwa odrębne gatunki ze względu na późniejszą selekcję naturalną, mutacje i dryf genetyczny.
Kladogeneza jest w przeciwieństwie do anagenezy, w której gatunek przodka stopniowo gromadzi zmiany, a ostatecznie, gdy wystarczająco dużo jest gromadzone, gatunek jest wystarczająco odrębny i wystarczająco różne od jego oryginalnej formy wyjściowej, że może być oznaczony jako nowa forma – nowy gatunek. Zauważ, że w przypadku anagenezy linia w drzewie filogenetycznym nie rozdziela się.
Aby określić, czy wydarzenie specjacji jest kladogenezą czy anagenezą, badacze mogą użyć symulacji, dowodów ze skamieniałości, dowodów molekularnych z DNA różnych żyjących gatunków lub modelowania. Dyskutuje się jednak, czy rozróżnienie między kladogenezą i anagenezą jest w ogóle konieczne w teorii ewolucji.
.