OMIM Entry – * 410000 – AMELOGENIN, Y-CHROMOSOMAL; AMELY

TEKST

W trakcie badania klonów fragmentów DNA z ludzkiego chromosomu Y, Nakahori i wsp. (1991) znaleźli klon, AMELY, który był szczególnie dobrze zachowany w ewolucji ssaków. Homologiczne sekwencje znaleziono na chromosomie X (AMELX; 300391). Sekwencje te były homologiczne z wcześniej sekwencjonowanymi klonami cDNA myszy i bydła kodującymi amelogeninę.

Salido i wsp. (1992) przedstawili dowody z badań męskich rozwijających się pąków zębowych, że zarówno gen AMGX, jak i gen AMGY są aktywne transkrypcyjnie. Przedstawiono region promotorowy i przewidywane sekwencje białkowe obu genów. Nie s± to geny pseudoautosomalne, gdyż samice heterozygotyczne dla mutacji w genie AMGX powoduj±cych amelogenesis imperfecta wykazuj± lyonization, czyli mozaikowaty wzór nieprawidłowości szkliwa.

Nakahori i wsp. (1991) zidentyfikowali 3 eksony w obu genach AMELY i AMELX.

Gen AMELY na chromosomie Y odpowiada genowi AMELX, który został zmapowany do chromosomu Xp22.3-p22.1 przez Lau et al. (1989). Lau et al. (1989) przypisali gen AMELY do pericentrycznego regionu chromosomu Y, prawdopodobnie Yq11, przez hybrydyzację do DNA z ludzkich komórek hybrydowych myszy zawierających różne delecje chromosomów X i Y. Możliwy związek z chromosomalnym locus Y postulowanym dla wielkości zębów, które mapuje w przybliżeniu ten sam obszar (patrz 475000), jest niejasny.

Gen amelogeniny u myszy wydaje się być zlokalizowany wyłącznie na chromosomie X (Chapman i in., 1991).

Przez mapowanie delecyjne, oparte na analizie DNA od serii pacjentów płci męskiej XX (z wymianą X-Y) i osobników z aberracyjnymi chromosomami Y, Bailey i wsp. (1992) uzyskali wyniki sprzeczne z doniesieniami mapującymi AMELY do proksymalnego Yq. Ich ustalenia dotyczące lokalizacji na Yp można by pogodzić postulując istnienie polimorfizmów inwersji pericentrycznej na Y w populacji ogólnej. Ta hipoteza może być przetestowana przez użycie hybrydyzacji in situ w celu zbadania lokalizacji Y AMELY na dużej serii normalnych chromosomów Y.

Faerman et al. (1995) opracowali czułą i wiarygodną metodę opartą na amplifikacji genu AMG do identyfikacji płci w archeologicznych szczątkach ludzkich. Allel AMGY posiada niewielką delecję w pierwszym intronie, ułatwiającą zaprojektowanie odrębnych starterów PCR specyficznych dla X i Y. Za pomocą tej metody określono płeć na podstawie szczątków szkieletowych 18 osobników, w tym małych dzieci, z 22 przebadanych z okresów od 200 do około 8000 lat temu. Stwierdzono, że kości korowe i czaszkowe, a także zęby, dostarczają wystarczająco zachowanego DNA.

Lattanzi et al. (2005) znaleźli dużą międzywyrostkową delecję krótkiego ramienia Y obejmującego locus AMELY u 2 niespokrewnionych osób. Jeden przypadek został zidentyfikowany w próbie 493 niepłodnych mężczyzn; drugi powstał w wyniku badań przeprowadzonych na 13,000 niewyselekcjonowanych próbkach płynu owodniowego z ciąż płodów męskich (wskazując na ogólną częstość występowania 0.008%). Lattanzi i wsp. (2005) stwierdzili, że chociaż częstość występowania delecji amelogeniny jest niska, nie należy wyciągać wniosków dotyczących płci na podstawie samej amelogeniny w sytuacjach związanych z diagnostyką prenatalną, testami na ojcostwo lub dochodzeniami kryminalnymi.

Używając kombinacji mapowania delecji STS, haplotypowania markerów binarnych i krótkich tandemowych powtórzeń Y oraz szacowania liczby kopii TSPY (480100), Jobling i wsp. (2007) zidentyfikowali 4 odrębne klasy delecji wpływających na chromosom Yp u 45 mężczyzn z 12 różnych populacji. Najczęstsza klasa delecji występowała w 41 chromosomach Y (91%) i wydawała się być spowodowana niealleliczną rekombinacją homologiczną pomiędzy główną matrycą powtórzeń TSPY a pojedynczą telomeryczną kopią genu TSPY znajdującą się ponad 3 Mb od matrycy. Delecja ta spowodowała utratę genów AMELY, TBL1Y (400033) i PRKY (400008), które leżą w regionie oddzielającym pojedynczy gen TSPY od matrycy powtórzeń TSPY, jak również redukcję liczby kopii TSPY. Rzadsze klasy delecji nie obejmowały głównej matrycy powtórzeń TSPY, ale powodowały utratę bardziej telomerycznego genu PCDH11Y (400022) oprócz AMELY, TBL1Y, PRKY i pojedynczej telomerycznej kopii TSPY. Trwałość i ekspansja linii delecyjnych, wraz z dowodami fenotypowymi, sugeruje, że brak tych genów nie ma większego szkodliwego wpływu.

Przez analizę PCR, Bailey et al. (1992) znaleźli niezwykły stopień zachowania starterów AMELY i wielkości produktu PCR wśród małp człekokształtnych i małp Starego Świata.