Alternatywne protokoły walki z rakiem wykorzystują terapię enzymatyczną w wysokich dawkach do rozbijania guzów, oczyszczania układu krwionośnego z resztek i stymulowania funkcji immunologicznych. Enzymy systemowe, stosowane w tych protokołach, rozbijają powłokę ochronną wirusów, uwalniając je tak, że mogą zostać zidentyfikowane i zaatakowane przez układ odpornościowy. Wirusy i inne mikroorganizmy chorobotwórcze znacznie zwiększają obciążenie toksyczne, obciążając układ odpornościowy. Wyeliminowanie tych infekcji jest najważniejsze dla optymalnego funkcjonowania układu odpornościowego.
Ten sam proces dotyczy komórek rakowych. Kiedy fibryna zostaje rozbita, układ odpornościowy jest w stanie skuteczniej namierzyć patogennych najeźdźców. Enzymy zwiększają również funkcje immunologiczne poprzez stymulację cząsteczek odpornościowych, takich jak cytokiny, makrofagi i naturalne komórki zabójcze. Z układem odpornościowym działającym na pełnych obrotach, może on zająć się swoimi obowiązkami zapobiegania wzrostowi i rozprzestrzenianiu się raka.
Enzymy systemowe zwiększają skuteczność konwencjonalnych terapii przeciwnowotworowych, takich jak chemioterapia i radioterapia. Chemioterapia jest w stanie lepiej zaatakować komórki rakowe, gdy fibryna jest rozbita, a niższe dawki mogą być stosowane. Ze względu na ich działanie przeciwzapalne i przeciwbólowe, enzymy są pomocne w łagodzeniu negatywnych skutków ubocznych chemioterapii, takich jak wymioty, ból, utrata mięśni i wyczerpanie. Enzymy są również pomocne w rozbijaniu tkanki bliznowatej, która jest skutkiem ubocznym napromieniowania. Co więcej, pacjenci szybciej wracają do zdrowia po operacji, gdy przyjmują enzymy.