Zaczynamy od wprowadzenia do odpowiedniej biologii, wyjaśniając co mierzymy i dlaczego. Następnie skupiamy się na dwóch głównych technologiach pomiarowych: sekwencjonowaniu następnej generacji i mikromacierzach. Następnie przechodzimy do opisu, jak surowe dane i informacje eksperymentalne są importowane do R i jak używamy klas Bioconductor do organizacji tych danych, zarówno wygenerowanych lokalnie, jak i pobranych z publicznych repozytoriów lub archiwów instytucjonalnych. Cechy genomowe są zazwyczaj identyfikowane przy użyciu interwałów we współrzędnych genomowych, a wysoce wydajne algorytmy do obliczeń z interwałów genomowych będą szczegółowo badane. Metody statystyczne do testowania genocentryczne lub ścieżki-centric hipotezy z genomu-skali danych można znaleźć w pakietach takich jak limma, niektóre z tych technik będą ilustrowane w wykładach i laboratoriach.
Given różnorodność w edukacji tle naszych studentów podzieliliśmy serię na siedem części. Możesz wziąć całą serię lub poszczególne kursy, które Cię interesują. Jeśli jesteś statystykiem, powinieneś rozważyć pominięcie pierwszych dwóch lub trzech kursów, podobnie, jeśli jesteś biologiem, powinieneś rozważyć pominięcie niektórych wykładów z biologii wprowadzającej. Zauważ, że statystyki i aspekty programowania w klasie ramp up w trudności stosunkowo szybko w ciągu pierwszych trzech kursów. Do trzeciego kursu będą nauczane zaawansowane koncepcje statystyczne, takie jak modele hierarchiczne, a do czwartego zaawansowane umiejętności inżynierii oprogramowania, takie jak obliczenia równoległe i powtarzalne koncepcje badawcze.
Te kursy składają się na dwa certyfikaty Professional Certificates i są prowadzone samodzielnie:
Data Analysis for Life Sciences:
- PH525.1x: Statystyka i R dla nauk przyrodniczych
- PH525.2x: Introduction to Linear Models and Matrix Algebra
- PH525.3x: Statistical Inference and Modeling for High-throughput Experiments
- PH525.4x: High-Dimensional Data Analysis
Genomics Data Analysis:
- PH525.5x: Wprowadzenie do Bioconductor
- PH525.6x: Case Studies in Functional Genomics
- PH525.7x: Advanced Bioconductor
Ta klasa była częściowo wspierana przez NIH grant R25GM114818.
HarvardX wymaga od osób, które zapisują się na jego kursy na edX, aby przestrzegały warunków kodeksu honorowego edX. HarvardX podejmie odpowiednie działania naprawcze w odpowiedzi na naruszenia kodeksu honorowego edX, które mogą obejmować usunięcie z kursu HarvardX; cofnięcie wszelkich certyfikatów otrzymanych za kurs HarvardX; lub inne środki zaradcze w zależności od okoliczności. W przypadku działań naprawczych za takie naruszenia nie będą wydawane zwroty pieniędzy. Uczestnicy, którzy biorą udział w kursach HarvardX jako część innego programu, będą również podlegać zasadom akademickim tych programów.
HarvardX realizuje naukę o nauce. Rejestrując się jako uczeń online w kursie HX, będziesz również uczestniczyć w badaniach nad uczeniem się. Przeczytaj nasze oświadczenie dotyczące badań, aby dowiedzieć się więcej.
Uniwersytet Harvarda i HarvardX są zobowiązane do utrzymania bezpiecznego i zdrowego środowiska edukacyjnego i pracy, w którym żaden członek społeczności nie jest wykluczony z udziału w naszym programie, nie jest pozbawiony korzyści z niego płynących, ani nie jest obiektem dyskryminacji lub molestowania. Od wszystkich członków społeczności HarvardX oczekuje się przestrzegania zasad Harvardu dotyczących niedyskryminacji, w tym molestowania seksualnego, oraz Warunków korzystania z serwisu edX. W razie jakichkolwiek pytań lub wątpliwości prosimy o kontakt pod adresem [email protected] i/lub zgłoszenie swojego doświadczenia poprzez formularz kontaktowy edX.