ZARZADZANIE WYNIKAMI WYSZUKIWANIA BADAŃ PRIMARYJNYCH
Wykorzystanie oprogramowania do zarządzania bibliograficznymi referencjami zostało początkowo zaproponowane do badań w ramach przeglądów systematycznych (SR), a pierwsze publikacje na temat zastosowania tego systemu pochodzą z lat 90. ubiegłego wieku.17-18 Wielu recenzentów korzysta z arkuszy kalkulacyjnych Microsoft Excel, inni wybierają badania ręcznie, drukując tytuły i streszczenia, co czyni ten proces złożonym, nieekologicznym i czasochłonnym. Obecnie przepływ pracy w procesie przeglądu jest bardziej usprawniony dzięki wykorzystaniu programów komputerowych.19 W badaniu opublikowanym w 2013 roku autorzy zwrócili uwagę, że ponad połowa przeglądów systematycznych korzystała z oprogramowania EndNote®.20 Ponieważ SR są podobne do IR, proponuje się wykorzystanie tej technologii w celu ułatwienia procesu selekcji badań pierwotnych.
Wybór programu powinien jednak odpowiadać indywidualnym potrzebom recenzenta, ponieważ każde narzędzie ma swoje wady i zalety.21-22 Na przykład łatwość obsługi Mendeleya® jest jedną z jego mocnych stron. Z drugiej strony, słabą stroną tego menedżera jest brak możliwości przeszukiwania baz danych w obrębie własnej struktury, nie pozwala on również na dynamiczne zmiany w formatowaniu cytowań w tekstach.22 Konieczne jest więc poznanie każdego oprogramowania, aby zidentyfikować to, które najlepiej dostosowuje się do każdego recenzenta, dlatego warto wspomnieć o wykorzystaniu EndNote®, z którego autorzy niniejszego artykułu korzystają od ponad 15 lat.
W niniejszych rozważaniach omówimy wykorzystanie oprogramowania EndNote®, wersja XV. Należy zauważyć, że istnieje bezpłatna wersja online (EndNote® Basic) dostępna na stronie internetowej Thomson Reuters (www.endnote.com), która nie posiada wszystkich funkcji dostępnych w wersji płatnej.
Przy tworzeniu pliku w EndNote® można również zarysować różne grupy w celu uporządkowania wyszukiwania. Po przeszukaniu badań pierwotnych w bazach danych, w których recenzent skrzyżował kontrolowane deskryptory i słowa kluczowe ze strategii PICO, można łatwo wyeksportować wyszukiwanie w pliku i zaimportować za pomocą filtrów do EndNote®. Na przykład przeszukiwanie bazy PubMed wymaga wybrania filtru „PubMed (NLM)”; w bazie LILACS filtrem z wyboru jest „Reference Manager (RIS)”. Inne bazy danych, takie jak CINAHL i Web of Science, pozwalają na bezpośredni import referencji poprzez dwukrotne kliknięcie na plik wyeksportowany z bazy danych. EndNote® udostępnia swoim użytkownikom kanał YouTube z różnymi filmami, które uczą, jak korzystać z tego oprogramowania (https://www.youtube.com/user/EndNoteTraining). Ponadto dostępne są darmowe, przyjazne dla użytkownika przewodniki.
Po zaimportowaniu wyszukiwania w EndNote® i skierowaniu rekordów odnoszących się do grupy wskazującej każdą bazę danych, zaleca się zapisanie pliku zapasowego z oryginalnym wyszukiwaniem, bez zarządzania zawartością, w celu odzyskania publikacji, które mogły zostać nieumyślnie wykluczone przez użytkownika, oprócz posiadania rekordu liczby referencji zidentyfikowanych w każdej bazie danych.
Inną funkcją jest zmiana (lub dostosowanie) dostępnych pól w bibliotece EndNote® w celu identyfikacji źródła każdego wyszukiwania. Użytkownik musi wybrać „Tools”, kliknąć „Change and Move Fields”, wybrać pole, na przykład „URL”, wybrać „Replace whole field with”, w prawej ramce wpisać nazwę bazy danych, do której odnosi się grupa wyeksportowanych referencji i kliknąć „OK”. Czynność ta zmienia całą zawartość kolumny referencji dla danej grupy. Po wykonaniu tej zmiany w każdej bazie danych, recenzent będzie miał dokładny zapis źródła każdej referencji. Powinna to być jedna z pierwszych czynności wykonywanych przez recenzenta. Krok po kroku dla opisywanej funkcji oraz innych ważnych poleceń dotyczących wykonywania metod przeglądowych dostępny jest na kanale YouTube „EndNote for Systematic Reviews „*.
Rysunek 2 przedstawia przykład tworzenia grup w obrębie bazy referencji przy opracowywaniu metod przeglądowych. W tym celu wystarczy kliknąć prawym przyciskiem myszy w obrębie „My Groups”, gdzie można tworzyć zestawy grup („Create Group Set”), a także nowe grupy w obrębie każdej większej grupy („Create Group”). Czynności te pozwalają na tworzenie różnych filtracji z zestawu zidentyfikowanych badań pierwotnych. Aby dodać referencje w każdej z grup, wystarczy wybrać publikację i przeciągnąć ją do wymaganej grupy.
Rysunek 2 Przykłady grup, które można utworzyć w selekcji badań pierwotnych do przeglądu integracyjnego, Ribeirão Preto, São Paulo, 2017
Używanie EndNote® pozwala również na zmianę pól w obrębie bazy referencji, w celu zarządzania kryteriami włączenia i wykluczenia, które wykonali niezależni recenzenci. W tym przypadku każdy odnośnik otrzymuje etykietę, z jednym lub kilkoma kodami, uzasadniającymi włączenie lub wykluczenie badania pierwotnego przez każdego recenzenta. W literaturze, w jednym z opublikowanych opracowań, autorzy opracowali przewodnik, jak korzystać z funkcji EndNote®, aby umożliwić wybór badań pierwotnych w sposób rygorystyczny i zorganizowany.23
W trakcie wyboru badań pierwotnych należy unikać powtórzeń (duplikacji badań) w wyszukiwaniach prowadzonych w różnych bazach danych. Przed usunięciem zduplikowanych badań należy zmienić nazwę kolumny „URL”, wskazując bazę danych z referencji, jak wspomniano wcześniej. Jak pokazano na Rysunku 3, można utworzyć grupę o nazwie „Duplicate Studies” i do tego folderu kierować wszystkie powtarzające się referencje.
Rysunek 3 Demonstracja faz eksportu do oprogramowania EndNote®, Ribeirão Preto, São Paulo, 2017
Aby wybrać zduplikowane badania, recenzent powinien kliknąć na górną zakładkę o nazwie „References” i wybrać opcję „Find Duplicates”. Dzięki tej czynności program podświetla zduplikowane referencje. Następnym krokiem jest usunięcie tych referencji, co powoduje wysłanie zduplikowanych tekstów do folderu „Unfiled”. Jeśli program wyśle zduplikowane referencje do kosza oprogramowania, musisz ponownie zaznaczyć te rekordy, kliknąć prawym przyciskiem myszy i wybrać opcję „Przywróć do biblioteki”. Ta akcja kieruje odzyskane referencje do folderu „Unfiled”, gdzie można je dodać do folderu zainteresowania, jak już wspomniano. Odpowiednim krokiem jest zaznaczenie wszystkich tekstów przekazanych do folderu „Unfield”, kliknięcie prawym przyciskiem myszy i dodanie tych referencji („Add References To”) do folderu, który będzie zawierał zduplikowane badania. Możliwe, że po wykonaniu tej czynności nadal pozostanie jakieś zduplikowane opracowanie, ponieważ referencje zostały pobrane z różnych baz i nie zawsze są indeksowane identycznie.
W celu wybrania roku publikacji, na przykład z ostatnich pięciu lub dziesięciu lat, recenzent powinien kliknąć na kolumnę „Year”, która pojawia się jako nagłówek bezpośrednio przed referencjami. Po kliknięciu na tę kolumnę program sortuje referencje według roku publikacji w porządku rosnącym i malejącym. Recenzent może zaznaczyć referencje z interesujących go lat i wykonać tę samą czynność, którą opisano wcześniej, czyli usunąć referencje, które nie mieszczą się w wyznaczonym przedziale czasowym, odsyłając je do folderu „Unfiled”. Następnie recenzent powinien zaznaczyć wszystkie teksty przesłane do tego folderu, kliknąć prawym przyciskiem myszy i dodać te referencje („Add References To”) do folderu, który będzie zawierał badania opublikowane w okresie nie wybranym do stworzenia próby przeglądu.
Dla celów identyfikacji języka istnieją dwa sposoby. Pierwszym z nich jest wyszukiwanie w obrębie bazy referencyjnej. Recenzent powinien zauważyć, że klikając na dowolny folder utworzonych grup, można przeszukiwać różne pola za pomocą narzędzia „Szukaj”. Klikając na istniejące opcje wyszukiwania, recenzent powinien wybrać pole „Language”. Po tej czynności należy wpisać języki, których recenzent nie zna lub którymi nie jest zainteresowany. W zależności od bazy danych, z której pobrano opracowanie, język może być szczegółowo opisany lub identyfikowany za pomocą trzech początkowych liter, na przykład „eng” dla określenia języka angielskiego. Drugi sposób polega na użyciu tego samego narzędzia „Search”, wybraniu pola „Title” w opcjach wyszukiwania i wpisaniu symbolu nawiasu „[„, ponieważ w większości przypadków bibliografie, które są w języku innym niż angielski, mają swoje tytuły w języku angielskim w nawiasach. Po tej czynności recenzent powinien usunąć te referencje, przesyłając artykuły do folderu „Unfiled”. Następnie należy zaznaczyć wszystkie teksty przekazane do tego folderu, kliknąć prawym przyciskiem myszy i dodać te referencje („Add References To”) do folderu, który będzie zawierał referencje opublikowane w innych językach, które nie będą stanowiły części próby recenzyjnej.
W celu identyfikacji tekstów, które nie są artykułami naukowymi, recenzent powinien kliknąć na kolumnę „Ref Type”, która pojawia się jako nagłówek bezpośrednio przed opracowaniami wymienionymi w bazie referencyjnej. Klikając na tę kolumnę, program porządkuje referencje zgodnie z ich typem, ułatwiając np. identyfikację prac dyplomowych i rozdziałów książek.
Inną przydatną funkcją programu jest podsumowanie publikacji, ważny aspekt przy wyborze badań pierwotnych, które zostaną włączone do IR, poprzez przeczytanie tytułu i podsumowania każdej referencji. Tak więc, po kliknięciu na folder zainteresowania, w tym samym miejscu, gdzie wyszukiwanie odbywa się w ramach samych referencji, jest ikona o nazwie „Preview”, która pozwala na pełną wizualizację odniesienia i streszczenia. Należy pamiętać, że w tym widoku, w górnej zakładce, gdzie można wybrać styl odniesienia, należy kliknąć „Annotated”, w przeciwnym razie użytkownik zobaczy ostatni styl odniesienia używany do formatowania odniesień.
Aby uzupełnić zalety korzystania z EndNote®, program ten zawiera również narzędzie do wyszukiwania pełnotekstowego. W tym celu recenzent powinien zaznaczyć referencje, kliknąć prawym przyciskiem myszy i wybrać opcję „Find Full Text”. Należy zaznaczyć, że program wyszukuje grupy 250 odsyłaczy, dlatego recenzent powinien zwrócić na to uwagę przy wyszukiwaniu tekstów w formacie Portable Document Format (PDF). Ta funkcjonalność programu jest również uwarunkowana IP komputera, pobierając większą liczbę tekstów w instytucjach zrzeszonych w portalach naukowych, lub gdy możliwy jest zdalny dostęp poza środowiskiem akademickim poprzez usługę Virtual Private Network (VPN).
.