Desde por volta de 1850, a bandeira do Camboja tem uma representação de Angkor Wat no centro. A bandeira atual, com um bonce azul em 1948. Foi usada até 9 de Outubro de 1970, quando uma nova bandeira foi introduzida para a República Khmer do Lon Nol que durou até à aquisição do Khmer Vermelho em 1975. O estado subsequente do Kampuchea Democrático, que existiu de 1975 a 1979, usou uma bandeira vermelha com um desenho Angkor Wat de três torres retidas em amarelo a partir de 1976. A República Popular do Kampuchea foi estabelecida em 1979, após a invasão vietnamita do Camboja.
A Frente Nacional Unida Kampucheana para a Salvação Nacional (FUNSK) ressuscitou a bandeira adotada pelo Khmer Issarak nos dias de resistência anti-Francês para o novo estado. Esta bandeira tinha o mesmo padrão de cor da bandeira DK, mas com uma silhueta amarela de cinco torres de Angkor Wat. Quando o PRK se renomeou como “Estado do Camboja” (SOC) em 1989, a metade inferior da bandeira ficou azul. A bandeira UNTAC foi usada durante o período de transição 1992-1993 juntamente com a bandeira do SOC no Camboja.
Em 1993, a bandeira do Camboja de 1948 foi readoptada. A actual bandeira cambojana, juntamente com as bandeiras do Afeganistão, Bolívia, Portugal, São Marino e Espanha, são as únicas seis bandeiras de estado a ter um edifício. Vermelho e azul são cores tradicionais do Camboja.
A bandeira usada hoje é a mesma que foi estabelecida em 1948, embora se diga que a bandeira mais antiga tenha usado um contorno vermelho para Angkor Wat, enquanto a bandeira actual usa especificamente o preto. Desde essa altura, foram utilizados cinco outros desenhos intervenientes. Quase todos fizeram uso da imagem do templo de Angkor Wat, de uma forma ou de outra. Este famoso local do templo, que data do século XII, foi construído pelos monarcas Mahidharapura. Tem cinco torres, mas estas nem sempre foram todas retratadas na versão estilizada usada nas bandeiras. A monarquia foi restaurada em Setembro de 1993, tendo a bandeira de 1948 sido readoptada em Junho do mesmo ano.