O capsomere é uma subunidade da cápsula, uma cobertura externa de proteína que protege o material genético de um vírus. Capsomeres auto-montagem para formar a cápside.
Neste diagrama de um Adenovírus, as moléculas da cápside são claramente visíveis.
Subunidades chamadas protomers agregadas para formar capsomeres. Vários arranjos de capsômeros são: 1) Icosaédrico, 2) Helicoidal, e 3) Complexo.
1) Icosaédrico – Um icosaedro é um poliedro com 12 vértices e 20 faces. Dois tipos de capsómeros constituem o capitel icosaédrico: pentagonal (pentões) nos vértices e hexagonal (hexões) nas faces. Há sempre doze pentões, mas o número de hexões varia entre os grupos de vírus. Nos micrografos electrónicos, os capsómeros são reconhecidos como anéis espaçados regularmente com um orifício central.
2) Helicoidal – Os protomeros não são agrupados em capsômeros, mas são ligados uns aos outros de forma a formar uma estrutura em forma de fita. Esta estrutura dobra-se numa hélice porque os protomers são mais espessos numa extremidade do que na outra. O diâmetro da hélice é determinado pelas características dos seus protomeros, enquanto que o seu comprimento é determinado pelo comprimento do ácido nucleico que encerra.
3) Complexo – por exemplo, aquele exibido por poxvírus e rabdovírus. Este grupo compreende todos aqueles vírus que não se encaixam em nenhum dos dois grupos acima. Quando a partícula viral entra numa célula hospedeira, as enzimas celulares hospedeiras digerem a cápsula e seus capsômeros constituintes, expondo assim o material genético nu (DNA/RNA) do vírus, que posteriormente entra no ciclo de replicação.
Os capsômeros protegem contra danos físicos, químicos e enzimáticos e se multiplicam redundantes; tendo algumas subunidades proteicas que se repetem. Isto porque o genoma viral está sendo tão econômico quanto possível, necessitando apenas de alguns poucos códons de proteína para fazer uma grande estrutura. Uma das principais funções de um capsid é introduzir o genoma viral fechado nas células hospedeiras, adsorvendo-se prontamente nas superfícies celulares hospedeiras.