Cardinal Mooney foi fundado em 1956 e é dirigido pela Diocese Católica Romana de Youngstown. No início dos anos 50, a Diocese de Youngstown reconheceu a necessidade de expandir a Ursuline High School e de construir uma nova escola secundária paroquial na zona sul. Em 1953, o Bispo Emmet M. Walsh obteve do Departamento de Parques de Youngstown o atual local do Cardeal Mooney High School e iniciou a organização de um comitê de arrecadação de fundos para o liceu.
O liceu foi quebrado em 1954, e no outono de 1955 foi organizada a primeira turma de calouros e começou a freqüentar as aulas no antigo convento Glenmary. A construção do Cardeal Mooney foi concluída a tempo para o primeiro dia de aula, em setembro de 1956. Um total de 610 alunos foram matriculados como calouros ou alunos do segundo grau. A escola recebeu o nome do Cardeal Edward Mooney, um ex-Sul, Arcebispo de Detroit. Ele se distinguiu como estudioso e diplomata do Vaticano.
Pai William Anthony Hughes, mais tarde o Bispo de Covington, Kentucky, foi nomeado o primeiro diretor da escola. O vermelho e o dourado foram escolhidos como as cores da escola. Eles simbolizavam o sangue dos mártires e a responsabilidade de todos os cristãos de aceitar o sofrimento e o Santíssimo Sacramento.
A faculdade inicial incluía irmãs das comunidades Ursulina, Dominicana, Notre Dame e Vicentina, dois sacerdotes e cinco professores leigos.
Em junho de 1959 a primeira turma celebrou a Missa do Bacharelado na Catedral de St. Columba, e no dia 7 de junho foram realizadas cerimônias de formatura no Auditório Stambaugh.
As matrículas cresceram rapidamente no início dos anos 60. Em 1960 estava sendo planejado um acréscimo ao Cardeal Mooney e um transbordamento de alunos estava mais uma vez freqüentando as aulas no antigo Convento Glenmary. A adição foi aberta em 1961. Incluía um auditório, sete salas de aula e um laboratório de física.
No início de 2000, o Cardeal Mooney entrou em posse dos dois edifícios anexos militares adjacentes ao recinto da escola. Logo após a obtenção deste imóvel, estava em andamento a construção do novo complexo desportivo do liceu. Concluído no final de 2001, o complexo desportivo do Cardeal Mooney produz uma instalação de treino atlético bem arredondada onde podem ser realizadas competições atléticas oficiais da OHSAA. O complexo inclui um campo de futebol regulamentado, dois campos de treino adjacentes, duas quadras de tênis, um campo de treino de putting green, um campo de futebol de treino, dois campos de beisebol de treino, uma pequena jaula de rebatedores, uma piscina de treinamento e uma pista de borracha em todo o comprimento, circundando o campo principal de futebol. Os edifícios anexos do Exército dos EUA e da Marinha dos EUA foram deixados de pé durante a construção, mas o Rush Boulevard foi preenchido com terra de cima e cortado do lote traseiro. Os edifícios, agora chamados de Cardeal Mooney Industrial Arts Center, foram desde então convertidos em garagens onde aulas de oficina podem funcionar em veículos e aulas de condução podem ser dadas durante as pausas de verão.
2013 relocationEdit
Em 3 de setembro de 2013, o Bispo da Diocese Católica Romana de Youngstown, George Murry, aprovou a relocação da escola secundária do lado sul de Youngstown para os subúrbios do Condado de Mahoning. No entanto, a sua aprovação foi satisfeita com estipulações que incluíam a prova de apoio financeiro suficiente tanto para um novo edifício da escola secundária como para um fundo de dotações para fornecer bolsas de estudo a estudantes que enfrentam a pobreza e outras restrições sociais.
Um estudo lançado em Abril de 2013 (realizado pela Catholic School Management, Inc.). em Madison, Connecticut) determinou que a escola sustentaria uma melhor matrícula e por um período de tempo mais longo se ela se mudasse.
O bispo Murry se opôs originalmente à mudança, afirmando que um grande fator nesta decisão era que seria mais barato fazer reformas do que construir um novo prédio. Além disso, disse na sua declaração, é importante que a diocese seja boa administradora das suas finanças. O superintendente diocesano das escolas católicas fez eco da posição original de Murry e reconheceu os planos que podem ser postos em prática para o futuro da escola na sua localização actual. O tema tem sido um tema de controvérsia entre pais e ex-alunos desde que a discussão sobre a mudança começou em 2013.
Para o ano escolar de 2015, começaram as renovações da atual localização, tornando, portanto, improvável a relocalização. A escola está em sua localização atual na Erie Street desde 1956.