Os valores centrais mantidos pela Cooperative Baptist Fellowship começam com quatro itens que o CBF considera princípios baptistas de fé e prática.
- A liberdade da alma é a capacidade de todas as pessoas se relacionarem diretamente com Deus. A crença no sacerdócio de todos os crentes é uma base importante para este princípio.
- A liberdade bíblica é o princípio de reconhecer a autoridade das Escrituras e o direito de cada cristão de interpretá-la como o Espírito Santo a dirige.
- A liberdade da igreja é a idéia de que cada igreja local é autônoma e tem o poder de escolher seus próprios líderes e dirigir seus próprios assuntos.
- A liberdade religiosa é o princípio de separação da igreja e do estado. A CBF apóia este princípio através da filiação ao Comitê Conjunto Batista para a Liberdade Religiosa.
A CBF afirma que a Bíblia ensina que existe um único Deus verdadeiro que criou todas as pessoas. Por causa do pecado, a humanidade está separada de Deus, mas pode ser salva e redimida através de Jesus Cristo. O Espírito Santo convence e converte aqueles que crêem em Cristo e fortalece a Igreja para cumprir a sua missão. Os membros da CBF concordam que cada cristão e cada igreja é chamada para cumprir a Grande Comissão, compartilhar o evangelho de Jesus Cristo e ministrar às necessidades espirituais, físicas e sociais das pessoas e comunidades.
A afirmação das mulheres no ministério foi um dos princípios fundadores da Irmandade. A maioria dos membros da CBF concorda que tanto homens como mulheres podem ser ordenados como ministros ou diáconos e servir como pastores de igrejas. Em questões sociais, a CBF não emite declarações de posição. Os membros da CBF concordam que, sendo uma Irmandade de igrejas autônomas, emitir declarações estaria além de seu propósito. No entanto, ela tem uma política organizacional sobre o comportamento homossexual. Contudo, as políticas da CBF não são vinculativas para as congregações individuais que tomam suas próprias decisões sobre qualquer questão; nem pode uma congregação ser excluída da CBF por discordar dos valores ou políticas fundamentais. Por exemplo, a Igreja Batista do Calvário em Lexington, KY, uma congregação membro líder da CBF permite que os homossexuais sirvam na liderança, incluindo o diácono da igreja e a Igreja Batista do Calvário em DC, outra congregação membro, realiza casamentos entre pessoas do mesmo sexo. Além disso, a CBF co-patrocinou uma conferência sobre sexualidade e iniciou o “‘Projeto de Iluminação’ aprovado pelo Conselho Diretor (antigo Conselho Coordenador) para desenvolver modelos para a comunidade da Fellowship para ventilar diferenças não só sobre a proibição de contratação, mas também outras questões de botão quente que dividem igrejas, denominações e sociedade”.