The Journal of Biomedical Informatics reflete um compromisso com artigos de pesquisa, revisões e comentários originais de alta qualidade na área de metodologia da informática biomédica. Embora publique artigos motivados por aplicações nas ciências biomédicas (por exemplo, medicina clínica, saúde, saúde populacional e bioinformática translacional), a revista enfatiza relatos de novas metodologias e técnicas que têm aplicabilidade geral e que formam a base para a evolução da ciência da informática biomédica. Artigos sobre dispositivos médicos; avaliações de sistemas implementados (incluindo ensaios clínicos de tecnologias de informação); ou artigos que forneçam insights sobre um processo biológico, uma doença específica ou opções de tratamento seriam geralmente mais adequados para publicação em outros locais. Artigos sobre aplicações de processamento de sinais e análise de imagens são frequentemente mais adequados para revistas de engenharia biomédica ou outras revistas de informática, embora publiquemos artigos que enfatizam a gestão da informação e questões de representação/modelagem do conhecimento que surgem no armazenamento e uso de sinais e imagens biológicas. Descrições de sistemas são bem-vindas se ilustrarem e fundamentarem a metodologia subjacente que é o foco principal do relatório e um esforço é feito para abordar a generalizabilidade e/ou alcance da aplicação dessa metodologia. Observe também que, dada a natureza internacional da JBI, documentos que lidam com idiomas específicos além do inglês, ou com sistemas ou abordagens de saúde específicos do país, só são aceitáveis para a JBI se oferecerem lições generalizáveis que sejam relevantes para o grande público leitor da JBI, independentemente de seu país, idioma, cultura ou sistema de saúde.
Que documentos são apropriados para a JBI?
Papers que respondem a uma necessidade na medicina, não apenas um conjunto de dados conveniente para analisar com métodos novos, que poderiam ir para uma revista de engenharia em vez disso.
Involvimento dos profissionais de saúde na motivação para o trabalho e avaliação dos resultados é geralmente necessário.
Aconselhamos os autores JBI de artigos originais de pesquisa a descrever trabalhos como os seguintes:
“Eu tinha um problema biomédico do mundo real, tentei técnicas existentes, mas não funcionaram. Então desenvolvi uma nova metodologia e avaliei sua adequação e a comparei com o estado da arte no meu domínio do mundo real. Isso me fez pensar que outros problemas esse novo método poderia ajudar a resolver. Relacionei-me a isto na Discussão e demonstrei que tenho uma nova metodologia genérica que não é específica para um domínio de aplicação restrito”
“Apesar de ter utilizado métodos ML existentes, criei e validei um ‘método de métodos’ que explica como aplicar os métodos existentes a um espaço de problemas biomédicos que partilham características únicas que influenciam a escolha de métodos.”
O que é informática biomédica?
“Informática biomédica é o campo interdisciplinar que estuda e busca os usos efetivos dos dados biomédicos, informação e conhecimento para a investigação científica, resolução de problemas e tomada de decisões, motivados pelos esforços para melhorar a saúde humana”.
C A Kulikowski et al, AMIA Board white paper: definition of biomedical informatics and specification of core competencies for graduate education in the discipline, Journal of the American Medical Informatics Association, vol. 19, no. 6, pp. 931-938, November 2012.
Que áreas da informática biomédica estão fora do escopo do JBI?
Papers about signal processing, imaging, medical devices, communication networks, security are usually outside the scope of JBI; even bioinformatics/disease modeling papers could be out of scope. Para serem considerados para a JBI, todos esses trabalhos devem introduzir novos métodos informáticos que se baseiam no profundo entendimento e utilização do conhecimento do domínio médico e devem ser traduzíveis em aplicações médicas. Exemplos de trabalhos que não se enquadram são aqueles que prevêem a estrutura de seqüências de DNA (não translacionais) ou trabalhos de modelagem de transmissão de doenças que não demonstram um entendimento e utilização da epidemiologia das doenças infecciosas ou que não são aplicáveis na prática.
Os métodos que são o foco dos trabalhos da JBI podem ser extraídos de qualquer uma das várias ciências componentes no campo da informática biomédica. Embora os métodos sejam frequentemente relacionados ao campo da informática, muitos artigos da JBI enfatizarão técnicas inovadoras de outros campos, como ciência da decisão, estatística, ciência cognitiva, psicologia, ciência da informação, teoria organizacional ou ciência da gestão.
Se você está considerando seu artigo de bioinformática para submissão à JBI, por favor esteja atento a este foco metodológico. Descobertas biológicas baseadas no uso de técnicas informáticas de rotina podem ser contribuições biológicas importantes, mas não são adequadas para a JBI. Além disso, favor notar que a JBI publica artigos de bioinformática somente se eles tratarem de assuntos da ciência translacional (humana). Veja o editorial Translational Bioinformatics que trata deste tópico antes de enviar seu artigo.
Artigos sobre privacidade ou segurança biomédica também devem oferecer metodologias novas e práticas que são claramente motivadas pelos desafios dos cuidados com a saúde e biomedicina. Um método estabelecido de outra área não merece ser republicado no JBI simplesmente porque foi aplicado a um problema biomédico. Também procuramos artigos que descrevam novidades metodológicas substanciais em vez de pequenas melhorias incrementais em técnicas publicadas anteriormente. Veja nosso editorial sobre Privacidade e Segurança para mais detalhes sobre nossas políticas para artigos aceitáveis nesta área.
Papers são geralmente de sete tipos:
1. Trabalhos de pesquisa regulares: Apresentação e discussão de um sistema ou abordagem biomédica ou clinicamente motivada que requereu o desenvolvimento de métodos inovadores em vez da aplicação de técnicas estabelecidas. Aplicações motivadoras podem ser discutidas, mas o novo método deve ser discutido para que a generalizabilidade seja clara, idealmente com uma avaliação da sua gama de aplicabilidade. Por favor escolha o tipo de artigo “Trabalho de Pesquisa” durante o processo de submissão.
2. Trabalhos de revisão metodológica: Revisões de uma abordagem metodológica que resume a sua introdução, uso, sucessos e limitações. Tais revisões também proporão freqüentemente futuras orientações de pesquisa ou criticarão um método e discutirão a gama de problemas para os quais ele pode não ser uma solução apropriada. Note que tais revisões devem focalizar um método ou abordagem, não em um domínio específico de aplicação (por exemplo, evite submeter em revisões como “Computadores em Gerenciamento do Diabetes”). Escolha o tipo de artigo “Artigo de Revisão” durante o processo de submissão.
3. Comentários: São artigos, geralmente mais curtos que artigos de pesquisa, que tendem a discutir artigos publicados anteriormente ou um tema que é uma importante área de foco para a base metodológica da pesquisa em informática biomédica e sua aplicação. Os comentários são frequentemente convidados, mas podem ser submetidos por qualquer pessoa após uma discussão com os editores. Se estiver sendo considerado o envio de um comentário, por favor envie uma breve proposta para [email protected] com antecedência. Se a sua submissão de um Comentário foi solicitada, ou aprovada pelo editor, por favor escolha o tipo de artigo “Discussões” durante o processo de submissão e especifique na carta de apresentação que o seu manuscrito pretende ser um Comentário.
4. Comunicações especiais:Estes são artigos que abordam um assunto de amplo interesse para a comunidade de pesquisa em informática orientada metodologicamente. Eles podem relatar os resultados de workshops ou estudos de pesquisa, geralmente oferecendo lições ou orientações que serão úteis para outros. Tais artigos não precisam relatar sobre novas metodologias informáticas inovadoras. Se estiver sendo considerado o envio de uma comunicação especial, por favor envie uma breve proposta para [email protected] com antecedência. Se sua submissão de uma Comunicação Especial foi aprovada pelo editor, por favor escolha o tipo de artigo “Discussão” durante o processo de submissão e especifique na carta de apresentação que o seu manuscrito se destina como Comunicação Especial.
5. Cartas para o Editor: As cartas podem ser enviadas e serão consideradas para possível publicação na revista. Normalmente, elas comentam um artigo publicado anteriormente. Por favor escolha o tipo de artigo “Correspondência” durante o processo de submissão.
6. Resenhas de livros: Os editores ocasionalmente identificarão um novo livro que possa ser de interesse para o público leitor da JBI. Eles convidarão indivíduos a escrever resenhas desses volumes, e tais submissões são apenas por convite. Resenhas de livros não solicitadas não serão consideradas. Por favor escolha o tipo de artigo “Resenha de livro” durante o processo de submissão.
7. Editoriais: Os editores ou seus convidados ocasionalmente publicarão editoriais, mas editoriais não-solicitados não serão considerados. Por favor, escolha o tipo de artigo “Editorial” durante o processo de submissão.
Quando um autor está submetendo um manuscrito em resposta a uma chamada de artigos para um número temático especial, a categoria de submissão deve ser o título do número especial, mas a carta de apresentação deve indicar se o artigo é uma revisão metodológica, um artigo regular, ou um comentário.
Outros antecedentes para revisão antes de submeter um artigo
The Journal of Biomedical Informatics (JBI), publicado pela primeira vez pela Academic Press em 1968 sob o título Computadores e Pesquisa Biomédica (CBR), foi redesenhado e renomeado a partir do Volume 34 em 2001. Com base em uma forte história de 33 anos desde a estreia da CBR em 1968, fizemos uma série de mudanças para atualizar e reorientar a revista à luz da evolução da área, ao mesmo tempo em que buscamos preencher um nicho não claramente identificado como foco central pelas outras revistas que publicam artigos em pesquisa de informática biomédica. Afirmamos esse objetivo em nosso editorial inaugural:
“É cada vez mais difícil publicar artigos que tenham amplo apelo para um público leitor diversificado. Por isso, decidimos que é importante introduzir um foco mais restrito à revista nos próximos anos, e é com isso em mente que renomeamos a revista para refletir uma ênfase mais moderna e estreita. A Journal of Biomedical Informatics (JBI) pretende ser um complemento e não uma competição com as outras grandes revistas da informática biomédica. Em particular, queremos enfatizar os artigos que elucidam as metodologias que generalizam os domínios biomédicos e que ajudam a formar a base científica para o campo. Os artigos tenderão a preocupar-se com a tecnologia da informação em vez de dispositivos médicos, e com os métodos subjacentes em vez de descrições de sistemas ou avaliações sumativas. Você deve esperar que esta revista seja uma excelente fonte de novas idéias sobre como enfrentar problemas difíceis que surgem no desenvolvimento de soluções computacionais para problemas nas ciências biomédicas e na prática clínica”
Com quase duas décadas de publicação sob o título JBI, estamos satisfeitos com o sucesso da revista. Tem uma reputação de excelência e rigor e esperamos que os nossos leitores e autores publicados fiquem igualmente impressionados com a qualidade tanto do trabalho como da escrita que atraímos para estas páginas.
JBI procura publicar artigos que façam uma contribuição conceitual para o campo, tipicamente descrevendo uma inovação em metodologia ou técnica ou discutindo lições generalizáveis substantivas que tenham sido aprendidas no contexto de um projeto informático interessante. Quando uma contribuição tem uma base teórica, essa teoria é também uma ênfase apropriada para a exposição. Em nossa experiência, muitos projetos de pesquisa que começam como esforços de aplicação resultam em inovação metodológica que, devidamente descrita, contribui para a base científica da nossa disciplina. Assim, não estamos desencorajando submissões que discutam aplicações interessantes, mas sim, encorajando uma perspectiva de como melhor escrever e compartilhar insights metodológicos generalizáveis que derivam do trabalho aplicado e dos quais outros podem se beneficiar. Acreditamos que tais artigos formam o núcleo da informática biomédica como uma ciência.
Existiram cinco razões principais para a devolução de artigos sem revisão. Talvez a mais comum ocorra quando um trabalho é principalmente uma descrição de uma aplicação informática ou sua avaliação. Um novo sistema clínico que trate de um problema clínico importante, mas que não ofereça nova metodologia, seria mais apropriado para outra revista, seja em informática aplicada ou no domínio clínico de aplicação. Da mesma forma, estudos de pesquisa/questionário ou análises das necessidades dos usuários provavelmente só serão adequados para a JBI se contribuírem com novos métodos para realizar tais estudos ou análises, ou novos insights sobre o comportamento do usuário, ciência cognitiva ou interação humano-computador.
Um segundo motivo para retornar artigos sem revisão ocorre quando um artigo não lida com as noções centrais de gestão da informação e do conhecimento. Mais comumente isso ocorre quando um artigo apresenta um novo dispositivo médico ou uma abordagem ao sinal biomédico ou processamento de imagens, especialmente quando a ênfase é em métodos numéricos ou monitoramento fisiológico em vez de processamento e gerenciamento de informações ou abordagens baseadas no conhecimento. Geralmente referimos esses artigos a revistas de engenharia biomédica ou a revistas clínicas no domínio da aplicação (por exemplo uma revista de cardiologia para novas abordagens de análise eletrocardiográfica, ou uma revista de imagens para uma nova abordagem matemática da segmentação ou outros aspectos da análise de imagens).
Terceiro, porque o campo da informática biomédica é motivado em todas as aplicações para ter um impacto positivo na saúde humana ou no tratamento de doenças humanas, os artigos de bioinformática submetidos à JBI devem estar na área da bioinformática translacional (TBI). Rejeitamos rotineiramente artigos sem revisão se eles lidam com soluções bioinformáticas básicas que são amplamente aplicáveis (por exemplo, métodos analíticos para microarrays), mas não são especificamente motivados pela saúde humana ou doença. Consequentemente, não publicamos artigos que lidem com bioinformática vegetal ou animal ou métodos genómicos especificamente para uso na agricultura ou zoologia.
Quatro, usamos software de apoio para avaliar cada submissão à JBI, procurando ver se há evidência de reutilização significativa de texto de outros artigos publicados. Em alguns casos, as publicações anteriores não são sequer citadas no novo artigo. Independentemente de os autores de um manuscrito serem também os autores de um trabalho do qual o texto foi reutilizado, geralmente recusamos a revisão de trabalhos que tenham sobreposição significativa com outras publicações. Tais práticas não só levam a preocupações de plágio (ou auto-plágio), como também levantam questões sobre a novidade do trabalho apresentado no novo manuscrito. Esperamos que todos os trabalhos sejam escritos de novo e pedimos que os manuscritos (e a carta de apresentação) deixem claro como o novo trabalho se baseia, aprimora ou supera as capacidades de trabalhos publicados anteriormente.
Finalmente, embora a JBI seja uma revista internacional e compreendamos os desafios que os autores enfrentam quando o inglês não é sua língua materna, alguns trabalhos têm problemas tão graves com sua exposição em inglês que os rejeitamos ou os devolvemos para revisão, sugerindo o envolvimento de um editor ou co-autor especialista em inglês antes que o trabalho possa ser julgado adequado para entrada no processo de revisão científica. Problemas menores de linguagem podem ser corrigidos no processo editorial, mas problemas mais graves impedem uma avaliação adequada da contribuição científica.
Dos artigos que foram para revisão, nossa taxa de aceitação eventual é agora de cerca de 25%. Todo artigo publicado só foi aceito após revisões significativas, portanto, os autores não devem se surpreender quando as revisões forem necessárias antes de um artigo estar pronto para publicação. Acreditamos, entretanto, que o rigor que introduzimos no processo de revisão e revisão resultou em um produto melhor e mais útil cientificamente. Por exemplo, o feedback anedótico, assim como a citação e o download de dados, sugerem que as revisões metodológicas incluídas em quase todos os números foram amplamente utilizadas para fins educacionais e de estudo.
Recebemos um número crescente de artigos submetidos a cada ano desde a transição da RBC para a JBI. Em nosso primeiro ano recebemos cerca de 100 manuscritos, mas agora recebemos bem mais de 800 trabalhos por ano. Como resultado, a revista cresceu em tamanho, com mais artigos por edição. Também dedicamos dois ou três números por ano a temas metodológicos especiais, supervisionados por editores convidados que nos propõem tais números especiais. Os artigos aceitos são imediatamente disponibilizados online e são indexados no Medline. Eles aparecem logo em um número “virtual” compilado no ScienceDirect. Desde 2016 deixamos de produzir uma versão impressa da JBI, tendo aprendido que a vasta preponderância do acesso à revista é através da Internet e do ScienceDirect. Cópias impressas dos números completos estão disponíveis na Elsevier através dos serviços Print on Demand. Os artigos podem ser publicados em acesso aberto por uma taxa paga pelos autores, mas de outra forma só estão disponíveis aos assinantes durante os primeiros 12 meses após a publicação. Depois disso, eles são abertos para acesso gratuito em nosso arquivo aberto do ScienceDirect. Como a revista é produzida apenas on-line, não há limite ou cobrança de taxas relativas ao uso de cores em figuras ou fotografias nos manuscritos submetidos.
Aconselhamos que você envie seu melhor trabalho metodológico para a JBI. Tenha em mente que oferecemos oportunidades para uma discussão aprofundada de uma abordagem inovadora, julgada tanto por nossos revisores quanto pelos editores, e evitamos qualquer limite arbitrário na contagem de palavras ou outras métricas relativas à extensão dos artigos individuais. Também encorajamos artigos que descrevem trabalhos de dissertação de doutorado, e enfatizamos que as extensas revisões temáticas realizadas em um documento de tese podem, muitas vezes, ser adaptadas para desenvolver um artigo de revisão metodológica que seja adequado para a JBI. A revista também não tem cobrança de página e pode incluir componentes multimídia para artigos no ambiente on-line.
A informática biomédica é um campo em expansão, com importantes aplicações e implicações em todo o mundo biomédico e clínico. Estamos ansiosos para que a comunidade de pesquisa identifique consistentemente a JBI como a revista que melhor define a base científica para o campo. Assim, convidamos tanto as suas contribuições como os seus leitores.
Mor Peleg
Editor em Chefe
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