Trimetoprim-sulfametoxazol (TMP-SMX), ou Bactrim*, Septra*, ou Cotrim*, é o tratamento de escolha. O regime típico para adultos imunocompetentes é TMP 160 mg mais SMX 800 mg (um comprimido de dupla resistência), por via oral, duas vezes ao dia, durante 7-10 dias. Os pacientes infectados pelo HIV podem precisar de cursos de terapia mais longos.
Ainda não foram identificadas alternativas altamente eficazes para pessoas alérgicas ao (ou intolerantes ao) TMP-SMX. As abordagens a serem consideradas para tais pessoas incluem observação e tratamento sintomático, uso de um antibiótico cuja eficácia contra o Cyclospora é baseada em dados limitados, ou dessensibilização ao TMP-SMX. Esta última abordagem deve ser considerada apenas para doentes seleccionados que necessitam de tratamento, que foram avaliados por um alergologista e que não têm uma alergia que ponha em risco a vida.
Dados anedóticos ou não publicados sugerem que as seguintes drogas são ineficazes: albendazol, trimetoprim (quando usado como agente único), azitromicina, ácido nalidíxico, tinidazol, metronidazol, quinacrina, tetraciclina, doxiciclina, e furoato de diloxanida. Embora dados de um pequeno estudo entre pacientes infectados pelo HIV no Haiti sugerissem que a ciprofloxacina poderia ter uma atividade modesta contra a Cyclospora, uma experiência anedótica substancial entre muitas pessoas imunocompetentes sugere que a ciprofloxacina é ineficaz.
* O uso de nomes comerciais é apenas para identificação e não implica endosso pelo Serviço de Saúde Pública ou pelo Departamento de Saúde e Serviços Humanos dos EUA.
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