Akademiska dynastier: Nussenzweigs

X

Privacitet & Cookies

Denna webbplats använder cookies. Genom att fortsätta godkänner du att de används. Läs mer, bland annat om hur du kontrollerar cookies.

Got It!

Annonser

Barn till professorer blir ofta själva professorer, hur ska man förklara detta? Jo, Det är enkel vetenskap, som Edinburghforskare kring Ian Deary och Stuart Ritchie etablerat i peer-reviewed forskning: Det bästa vetenskapliga beviset är a) att den engelska politiska eliten och adeln är ytterst intelligenta, och b) att barn från familjer med låga inkomster, särskilt invandrare och barn med mörk hudfärg, sällan kommer in på Oxbridge. Båda av goda vetenskapliga skäl.

I detta avseende är det ganska enkelt varför förvånansvärt många professorer har en professorspappa, och ibland också en professormamma. Ibland på samma universitet där deras genetiskt överlägsna och IQ-utrustade avkomma råkar ha studerat, eller till och med ta en egen fakultetsstol. Ibland räcker det helt enkelt med att säga sitt efternamn och erkänna, ja, den och den är faktiskt min pappa, mamma eller farbror, och alla akademiska dörrar öppnas som genom ett trollslag.

Mina läsare kanske minns två sådana exempel. MIT:s molekylärbiolog David Sabatini överskuggade länge sin akademiska far David Sabatini Senior, i själva verket är junioren så stor och inflytelserik att han förmodligen aldrig kommer att behöva dra tillbaka en artikel, oavsett vad som händer. Ett mycket annorlunda fall är det med den USA-baserade grekiska materialforskaren Katerina Aifantis och hennes far Elias Aifantis, som är så förvridet att till och med ett team av förhärdade psykiatriker förmodligen kommer att sluta slita sitt hår.

Det följande fallet är fallet med familjen Nussenzweig, där för åtminstone en av sönerna, professorn i immunologi vid Rockefeller University, hivforskaren, AAAS- och NAS-medlemmen Michel Nussenzweig, en ”alternativ karriär” kanske hade varit ett bättre alternativ. Det finns saker på PubPeer som åtminstone tyder på det. Några av dessa artiklar publicerades tillsammans med hans bror Andre Nussenzweig, cancerforskare vid National Cancer Institute (NCI) vid NIH i Bethesda.

Dess föräldrar var Ruth och Victor Nussenzweig (båda nu avlidna), mycket framstående immunologer från Brasilien som 1963 flydde från den fascistiska diktaturen och etablerade sig vid New York University (Ruth Nussenzweig flydde 1939 från nazisterna i Österrike). Deras son Michel studerade, tog examen och byggde upp hela sin akademiska karriär vid det närliggande Rockefeller-universitetet, där hans fakultetsstol är uppkallad efter hans två berömda doktorandmentorer, Zanvil Cohn och Ralph Steinman. Nu arbetar Michel Nussenzweig med att bota COVID-19 genom att studera virusneutraliserande antikroppar.

Nussenzweigs metod för immunoglobulinrekombination har hittills visat sig vara en rungande framgång, med artiklar som hamrats in i Nature, Cell och Science. Om det fungerade där, kommer det säkert också att få coronaviruset nedslitet som en motsträvig peer reviewer.

Låt oss börja med en artikel från Michels labb som författats tillsammans med hans bror och DNA-reparationsexpert Andre Nussenzweig.

Anne Bothmer, Davide F. Robbiani, Michela Di Virgilio, Samuel F. Bunting, Isaac A. Klein, Niklas Feldhahn, Jacqueline Barlow, Hua-Tang Chen, David Bosque, Elsa Callen, André Nussenzweig, Michel C. Nussenzweig 53BP1 reglerar DNA-ändförbindning, resektion och immunoglobulinklassombination..03.019

Detta verkar vara en återanvänd gel och står för två olika experiment, där två olika proteinkonstruktioner användes. Kanske ett misstag, där någon också av misstag beskurit banden när han av misstag kopierade in dem.

Mer olyckor från Michels Rockefeller-laboratorium, återigen med hans bror som medförfattare, där en av medförfattarna till ovanstående artikel återkommer som försteförfattare här:

Niklas Feldhahn, Elisabetta Ferretti, Davide F Robbiani, Elsa Callen, Stephanie Deroubaix, Licia Selleri, Andre Nussenzweig, Michel C Nussenzweig The hSSB1 orthologue Obfc2b is essential for skeletogenesis but dispensable for the DNA damage response in vivo The EMBO journal (2012) doi: 10.1038/emboj.2012.247

En annan medförfattare, UCSF-professorn Licia Selleri, förklarade på PubPeer vilka siffror exakt hennes laboratorium bidrog med (inte dessa). Hon tillade:

”Vi hade ingen del i flödescytometrianalyserna. Vi är säkra på att dr Feldhahn och dr Nussenzweig kommer att svara och ta itu med era frågor.”

Niklas Feldhahn är nu docent vid Imperial College London. År 2006 drogs hans doktorsavhandling från universitetet i Köln, Tyskland (Feldhahn et al JEM 2002) tillbaka på grund av ”felaktiga FACS-instrumentkompensationer”, medan en annan av Feldhahns medförfattare, Klein et al JEM 2004, hittills inte har fått några korrigeringar i litteraturen. Varken Feldhahn eller någon av Nussenzweigs har ännu funnit tid att svara. Denna Nature-artikel från Nussenzweigs kan vara ännu mer problematisk:

Simone Petersen, Rafael Casellas, Bernardo Reina-San-Martin, Hua Tang Chen, Michael J. Difilippantonio, Patrick C. Wilson, Leif Hanitsch, Arkady Celeste, Masamichi Muramatsu, Duane R. Pilch, Christophe Redon, Thomas Ried, William M. Bonner, Tasuku Honjo, Michel C. Nussenzweig, André Nussenzweig AID krävs för att initiera bildandet av Nbs1/gamma-H2AX-fokus och mutationer vid platser för klassväxling Nature (2001) doi: 10.1038/414660a

Det är ganska uppenbart att de två märkta spåren är identiska. Kan detta ske av en slump eller av misstag? Det beror på hur man definierar olyckshändelse eller misstag, kanske som att åka fast för dataförfalskning? Den här gången är det Andre Nussenzweig som är den sista och motsvarande författaren här. Men ingen av bröderna har svarat på PubPeer hittills, trots att de är primärt ansvariga seniora författare. Det kan finnas ett mönster, observera att den andra författaren till Nature-artikeln från 2001 är försteförfattare till Cell 2002:

Rafael Casellas, Mila Jankovic, Gesa Meyer, Anna Gazumyan, Yan Luo, Robert Roeder, Michel Nussenzweig OcaB krävs för normal transkription och V(D)J-rekombination av en delmängd av immunglobulin kappa gener Cell (2002) doi: 10.1016/s0092-8674(02)00911-x

Denna huvudförfattare Rafael Caselas är nu huvudforskare vid National Cancer Institute (NCI) vid NIH i Bethesda, där Andre Nussenzweig arbetar. Caselas publicerade även detta tillsammans med sin mentor Michel Nussenzweig:

R Caselas, T A Shih , M Kleinewietfeld, J Rakonjac, D Nemazee, K Rajewsky, M C Nussenzweig Contribution of receptor editing to the antibody repertoire Science (2001) doi: 10.1126/science.1056600

Detta är vad Elisabeth Bik kallar för bristfällig cytometri. De två rödmarkerade FACS-plottarna är både olika och märkligt lika, vilket de markerade cellpopulationerna antyder. Som om någon ritade om en datafil av ett flödescytometriprov på två lite olika sätt, för att stå för två olika experiment med olika rekombinerade antikroppar. Men läs vidare, det kan finnas en roligare förklaring!

Det här skämtet var inte trevligt att hända den här artikeln, i Science inte minst, och med en sådan medarbetare. Den tyske forskaren Klaus Rajewsky, född 1936, är en legendarisk titan inom genetik och immunologi, hans namn öppnar alla akademiska dörrar och tidskriftsportar. Som en sidofråga kan nämnas att hans son Nikolaus Rajewsky också gjorde det ganska bra inom genetiken, eftersom akademiska dynastier fungerar, allt är genetiskt arv av IQ, ni vet. Far och son Rajewsky korrigerade 2017 sin gemensamma Cell-artikel Xiao et al 2007 för ”duplicering av FACS-plotten”. Situationen verkar något lik den i Caselas et al 2001-artikeln, eftersom Rajewskys förklarade i korrigeringen:

”De små skillnaderna i procentsatserna i två av panelerna till höger beror på en uppdaterad FlowJo-mjukvara.”

Jag hoppas att Rajewskys stämde de stygga FlowJo-programvarutillverkarna eller åtminstone raderade den onda uppdateringen. I vilket fall som helst är det definitivt inte trevligt att hitta bevis för dataförfalskning i Klaus Rajewskis artiklar, särskilt som det redan fanns den tidigare nämnda återkallelsen 2006 med Feldhahn från Köln, som då redan hade åkt till USA för att arbeta med Michel Nussenzweig.

Ingen Feldhahn eller Caselas i nästa gemensamma artikel av Michel Nussenzweig och Klaus Rajewski dock:

Yair Dorsett, Kevin M. McBride, Mila Jankovic, Anna Gazumyan, To-Ha Thai, Davide F. Robbiani, Michela Di Virgilio, Bernardo Reina San-Martin, Gordon Heidkamp, Tanja A. Schwickert, Thomas Eisenreich, Klaus Rajewsky, Michel C. Nussenzweig MicroRNA-155 undertrycker aktiveringsinducerad cytidindeaminas-medierad Myc-Igh-translokation Immunity (2008) doi: 10.1016/j.immuni.2008.04.002

Den dåliga nyheten är att bilderna skiljer sig åt i ljusstyrka/kontrast samtidigt som de visar exakt samma gelskanning, varenda fläck i bakgrunden matchar. Varför skulle någon justera ljusstyrkan när man av misstag kopierar in en bild? Den goda nyheten är att den av samhället publicerade Journal of Immunology är lite av en bedrägerifabrik som låter saker som är mycket värre än detta glida fram, för mycket mindre viktiga personer.

Från vänster till höger: bristfällig cytometri, Michel Nussenzweig, Klaus Rajewsky. Originalfoto: MDC Berlin.

Men låt oss kort återvända till den onda flödescytometriprogramvaran som fabricerar olika siffror för identiska FACS-plottar. För detta är vad som måste ha hänt här:

Dimitris Skokos, Michel C. Nussenzweig CD8- DCs inducerar IL-12-oberoende Th1-differentiering genom Delta 4 Notch-liknande ligand som svar på bakteriell LPS The Journal of experimental medicine (2007) doi: 10.1084/jem.20062305

Den första författaren Dimitris Skokos blev stor inom läkemedelsindustrin och är adjungerad professor vid Rockefeller University. Han utbildade sig där under samma mentor som Michel Nussenzweig, tydligen lärde nobelpristagaren Ralph Steinman dem, citat:

”Gör allt för att förverkliga din första vetenskapliga observation. Lyssna aldrig på människor utan fantasi. Gör bara ditt bästa”

En del av Steinmans adepter tog tydligen hans råd alltför bokstavligt.

Nästa fall är bara en identiskt duplicerad bild, vilket i sig självt betyder lite. Men det verkar som om sådana saker eller värre saker tycks inträffa av misstag i Michel Nussenzweigs labb på Rockefeller.

Sergey Yurasov , Hedda Wardemann, Johanna Hammersen, Makoto Tsuiji, Eric Meffre, Virginia Pascual, Michel C. Nussenzweig Defective B cell tolerance checkpoints in systemic lupus erythematosus The Journal of Experimental Medicine (2005) doi: 10.1084/jem.20042251

Men nu en artikel utan Michel, men med Andre Nussenzweig. Som av någon anledning beslutat att inte korrigera litteraturen här:

Longyue L Cao, Xioaling Xu, Samuel F. Bunting, Jie Liu, Rui-Hong Wang, Longyue L. Cao, J. Julie Wu, Tie-Nan Peng, Junjie Chen, Andre Nussenzweig, Chu-Xia Deng, Toren Finkel Ett selektivt krav på 53BP1 i det biologiska svaret på genomisk instabilitet inducerad av Brca1-brist Molecular Cell (2009) doi: 10.1016/j.molcel.2009.06.037

”Undersökningen av bakgrunden underlättas av kontrastförstärkning.”

Av någon anledning uppvisar alla tre framhävda western blot-fragment identisk bakgrund. De två blå inramade är horisontella spegelvända kopior av varandra, men det tredje fragmentet visar ett gelband som är detsamma (vänster sida) och ett gelband som är helt annorlunda (höger sida). Med gröna pilar som pekar på vissa oegentligheter som tyder på radering eller annan digital retuschering. Men naturligtvis finns det även här andra, mindre tramsiga förklaringar.

Redaktionen för Molecular Cell citeras på PubPeer för över två år sedan med ”It was investigated and handled according to our Process for Post Publication Issues” (Det undersöktes och hanterades i enlighet med vår process för frågor efter publicering). Inga som helst åtgärder har vidtagits med anledning av denna artikel fram till idag. Den sista författaren, Toren Finkel från University of Pittsburgh, har flera publikationer på Pubpeer. En sådan publikation från hans laboratorium (Narayan et al Nature 2012) drogs tillbaka, officiellt för att den inte var reproducerbar.

Har det verkligen varit nödvändigt för bröderna Nussenzweig att bli vetenskapsmän som sina föräldrar, med en sådan inställning till dataintegritet? Ja, naturligtvis, det är precis så här biomedicinen utvecklas från en Nature-artikel till ett nytt NIH-bidrag. Och det är så Michel Nussenzweig kommer att bota COVID-19, med Nature-artiklar.

Donera!

Om du är intresserad av att stödja mitt arbete kan du lämna en liten dricks på 5 dollar här. Eller flera små dricks, öka beloppet som du vill (2x=10 euro; 5x=25 euro). Ditt generösa stöd till min journalistik kommer att bli mycket uppskattat!

€5,00

Annonser

.

Lämna en kommentar